48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_3655 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  100 
 
 		 254 aa  519  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  58.89 
 
 		 330 aa  305  6e-82  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  58.89 
 
 		 330 aa  304  8.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  53.91 
 
 		 329 aa  266  2.9999999999999995e-70  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  54.3 
 
 		 329 aa  258  9e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  52.57 
 
 		 337 aa  253  1.0000000000000001e-66  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  46.09 
 
 		 479 aa  241  9e-63  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  50.21 
 
 		 717 aa  222  4e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  44.49 
 
 		 252 aa  212  4.9999999999999996e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  44.74 
 
 		 340 aa  208  8e-53  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  44.36 
 
 		 340 aa  207  2e-52  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  43.4 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  43.08 
 
 		 711 aa  196  4.0000000000000005e-49  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  45.49 
 
 		 343 aa  194  1e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 340 aa  190  2e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  46.82 
 
 		 709 aa  185  7e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  42.11 
 
 		 335 aa  182  4.0000000000000006e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  40.45 
 
 		 181 aa  115  8.999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  51.52 
 
 		 100 aa  75.1  0.000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  48.53 
 
 		 102 aa  72.4  0.000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  38.75 
 
 		 276 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  36 
 
 		 125 aa  55.5  0.0000007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  26.83 
 
 		 256 aa  54.7  0.000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.31 
 
 		 266 aa  54.7  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  39.68 
 
 		 350 aa  55.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  38 
 
 		 106 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  26.86 
 
 		 277 aa  53.1  0.000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  44.62 
 
 		 102 aa  51.6  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  40 
 
 		 199 aa  50.8  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  37.88 
 
 		 102 aa  51.2  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  39.06 
 
 		 160 aa  50.1  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  25.94 
 
 		 580 aa  50.4  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 458 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  26.72 
 
 		 267 aa  49.7  0.00004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  26.13 
 
 		 344 aa  48.9  0.00008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  36.56 
 
 		 113 aa  48.5  0.00009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  43.28 
 
 		 126 aa  48.5  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.68 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  25.81 
 
 		 344 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  30.06 
 
 		 347 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.03 
 
 		 655 aa  46.6  0.0003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  23.66 
 
 		 265 aa  46.6  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  38.96 
 
 		 112 aa  45.8  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  37.66 
 
 		 112 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0462  cytochrome c class III  29.29 
 
 		 135 aa  43.5  0.003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000017841  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  34.92 
 
 		 130 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2250  cytochrome c class III  24.18 
 
 		 538 aa  42.4  0.008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000197158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>