77 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cag_1146 on replicon NC_007514
Organism: Chlorobium chlorochromatii CaD3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  100 
 
 		 426 aa  867    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  49.88 
 
 		 413 aa  488  1e-137  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0992  hypothetical protein  49.46 
 
 		 294 aa  270  4e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  46.95 
 
 		 279 aa  243  5e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1136  hypothetical protein  36.73 
 
 		 288 aa  192  1e-47  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0993  hypothetical protein  35.27 
 
 		 291 aa  177  4e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000916347  decreased coverage  0.0000889659 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0499  hypothetical protein  31.54 
 
 		 245 aa  150  3e-35  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.687971  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1541  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 656 aa  121  3e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0115719 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2189  cytochrome c family protein  24.95 
 
 		 600 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  27.71 
 
 		 655 aa  115  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0471  hypothetical protein  30.31 
 
 		 790 aa  112  9e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0674457  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5161  hypothetical protein  25.81 
 
 		 794 aa  87.8  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  24.01 
 
 		 867 aa  86.3  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0451  hypothetical protein  21.6 
 
 		 621 aa  82.8  0.00000000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.235672 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2339  hypothetical protein  26.12 
 
 		 272 aa  82.4  0.00000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.79 
 
 		 664 aa  76.6  0.0000000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2336  hypothetical protein  26.32 
 
 		 238 aa  74.3  0.000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0450  cytochrome c family protein  23.25 
 
 		 312 aa  72  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.297176 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2851  hypothetical protein  24.42 
 
 		 618 aa  71.2  0.00000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.581823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2757  hypothetical protein  24.19 
 
 		 621 aa  70.1  0.00000000007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2666  hypothetical protein  23.79 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2466  hypothetical protein  25.68 
 
 		 237 aa  70.1  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.437406 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0193  hypothetical protein  26.79 
 
 		 258 aa  69.3  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013731  Slin_6650  hypothetical protein  24.05 
 
 		 266 aa  68.6  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.237631  normal  0.336128 
 
 
-
 
NC_013732  Slin_6896  hypothetical protein  23.86 
 
 		 265 aa  68.9  0.0000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0091  cytochrome C family protein  25 
 
 		 256 aa  65.5  0.000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.22622 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  24.57 
 
 		 717 aa  63.9  0.000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  26.27 
 
 		 712 aa  63.5  0.000000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  26.65 
 
 		 429 aa  63.2  0.000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3261  cytochrome C family protein  25.16 
 
 		 656 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00342  putative exported protein of unknown function with cytochrome Cfamily domain  25.51 
 
 		 263 aa  62  0.00000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0201  hypothetical protein  23.83 
 
 		 258 aa  61.6  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  26.1 
 
 		 340 aa  61.2  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3068  cytochrome c family protein  25.75 
 
 		 650 aa  60.8  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3166  cytochrome C family protein  25.74 
 
 		 650 aa  60.1  0.00000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1087  hypothetical protein  26.6 
 
 		 258 aa  58.9  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1995  cytochrome C family protein  26.88 
 
 		 658 aa  58.9  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.279857  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  24.24 
 
 		 340 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1996  cytochrome C family protein  24.26 
 
 		 427 aa  57  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0405741  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 337 aa  57  0.0000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2495  cytochrome c family protein  26 
 
 		 646 aa  55.5  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.17 
 
 		 884 aa  53.9  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  23.79 
 
 		 658 aa  53.5  0.000007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  27.86 
 
 		 299 aa  53.1  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6281  hypothetical protein  24.05 
 
 		 610 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1154  cytochrome C family protein  24.86 
 
 		 1454 aa  52  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.08 
 
 		 806 aa  50.8  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  25.31 
 
 		 709 aa  50.8  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1125  cytochrome C family protein  23.89 
 
 		 426 aa  50.4  0.00005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.4798  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  23.85 
 
 		 658 aa  50.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.32 
 
 		 711 aa  50.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0877  cytochrome c class III  24.53 
 
 		 557 aa  49.7  0.00009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.934871  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  25.38 
 
 		 556 aa  49.3  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2850  cytochrome c family protein  23.91 
 
 		 309 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.448853  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2665  cytochrome c family protein  23.31 
 
 		 299 aa  48.9  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0517248  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0454  hypothetical protein  26.52 
 
 		 182 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2756  cytochrome c family protein  23.31 
 
 		 309 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0112  hypothetical protein  24.3 
 
 		 302 aa  47  0.0007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0873537  normal  0.846145 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0934  cytochrome C family protein  27.41 
 
 		 337 aa  45.8  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3165  cytochrome C family protein  25.94 
 
 		 436 aa  46.2  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3067  cytochrome c family protein  24.18 
 
 		 436 aa  45.1  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  23.47 
 
 		 316 aa  45.1  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3260  cytochrome C family protein  25.94 
 
 		 436 aa  45.4  0.002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0747  multiheme cytochrome  24.4 
 
 		 487 aa  45.1  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.568299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3542  cytochrome C family protein  23.45 
 
 		 1453 aa  45.1  0.002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3775  cytochrome c family protein  25.65 
 
 		 384 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.172971  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2664  hypothetical protein  25.38 
 
 		 262 aa  45.1  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0452808  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2699  cytochrome C family protein  24.07 
 
 		 328 aa  44.7  0.003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.840713  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3564  cytochrome C family protein  24.73 
 
 		 955 aa  44.3  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0588  hypothetical protein  26.09 
 
 		 607 aa  44.3  0.005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.221838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0076  cytochrome C family protein  24.76 
 
 		 1438 aa  43.9  0.005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0108  hypothetical protein  24.71 
 
 		 309 aa  43.9  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0397  cytochrome C family protein  25.68 
 
 		 299 aa  43.5  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.265526 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  24.49 
 
 		 314 aa  43.1  0.009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3118  cytochrome C family protein  25.73 
 
 		 334 aa  43.1  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3840  cytochrome C family protein  25.65 
 
 		 331 aa  43.1  0.009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000859924  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0299  hypothetical protein  21.12 
 
 		 627 aa  43.1  0.01  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>