52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_3578 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  100 
 
 		 458 aa  903    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  33.16 
 
 		 368 aa  115  1.0000000000000001e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  31.52 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  31.52 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  31.52 
 
 		 344 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  29.76 
 
 		 453 aa  84.3  0.000000000000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  29.94 
 
 		 347 aa  82  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  30.14 
 
 		 259 aa  79.7  0.0000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  29.53 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  29.53 
 
 		 231 aa  79  0.0000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  28.97 
 
 		 259 aa  79  0.0000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  27.9 
 
 		 233 aa  76.6  0.0000000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  26.36 
 
 		 231 aa  75.1  0.000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  25.7 
 
 		 231 aa  73.6  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  29.89 
 
 		 243 aa  72.8  0.00000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  26.94 
 
 		 228 aa  72  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  27.01 
 
 		 330 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 330 aa  57.4  0.0000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  33.61 
 
 		 171 aa  55.8  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  27.27 
 
 		 340 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  28.48 
 
 		 254 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 157 aa  51.6  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  33.33 
 
 		 154 aa  51.2  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 711 aa  50.8  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  35.63 
 
 		 143 aa  50.1  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  33.61 
 
 		 171 aa  49.7  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  29.76 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 340 aa  48.1  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  30.67 
 
 		 183 aa  48.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  33.94 
 
 		 220 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  26.12 
 
 		 252 aa  47.8  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  28.48 
 
 		 709 aa  47.8  0.0004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  32.95 
 
 		 156 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  27.92 
 
 		 343 aa  47  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  24.49 
 
 		 329 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  30.89 
 
 		 181 aa  46.2  0.001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 144 aa  46.2  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  25 
 
 		 178 aa  46.2  0.001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  30.63 
 
 		 217 aa  45.4  0.002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 144 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  29.36 
 
 		 219 aa  44.7  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  34.51 
 
 		 215 aa  44.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  26.17 
 
 		 147 aa  44.3  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1297  hypothetical protein  33.94 
 
 		 279 aa  44.3  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.581727  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  31.69 
 
 		 216 aa  44.7  0.004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  26.09 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  25.12 
 
 		 340 aa  44.3  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  27.22 
 
 		 717 aa  43.9  0.006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  26.04 
 
 		 179 aa  43.5  0.007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  26.09 
 
 		 884 aa  43.5  0.008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  28.23 
 
 		 157 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>