42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_6280 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  100 
 
 		 368 aa  716    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  34.51 
 
 		 347 aa  169  7e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  34.38 
 
 		 344 aa  162  9e-39  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  34.38 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  34.38 
 
 		 344 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  33.16 
 
 		 458 aa  113  5e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  32.61 
 
 		 233 aa  93.2  7e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  32.67 
 
 		 228 aa  89.7  7e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  32.52 
 
 		 231 aa  89  1e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  33.88 
 
 		 231 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  33.88 
 
 		 231 aa  86.7  6e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  31.9 
 
 		 231 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  28.22 
 
 		 243 aa  77  0.0000000000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  28.5 
 
 		 259 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 259 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 157 aa  68.6  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  31.25 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  25.89 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  31.82 
 
 		 144 aa  57  0.0000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  27.84 
 
 		 171 aa  55.5  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  27.72 
 
 		 453 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 217 aa  52.4  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  29.89 
 
 		 156 aa  50.4  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  30.06 
 
 		 171 aa  50.4  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  29.67 
 
 		 143 aa  49.7  0.00008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  26.6 
 
 		 215 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  23.89 
 
 		 216 aa  47.8  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  30.33 
 
 		 253 aa  47.8  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  31.43 
 
 		 147 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0580  cytochrome c family protein  27.37 
 
 		 252 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  24.73 
 
 		 219 aa  46.2  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  26.49 
 
 		 210 aa  45.8  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1836  cytochrome C family protein  29.55 
 
 		 658 aa  44.7  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  20.98 
 
 		 400 aa  44.7  0.002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  23.58 
 
 		 425 aa  45.4  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  30.86 
 
 		 183 aa  44.7  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  26.97 
 
 		 211 aa  44.3  0.003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  26.99 
 
 		 329 aa  44.3  0.004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  30.61 
 
 		 183 aa  43.1  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  42.7  0.009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  30.71 
 
 		 216 aa  43.1  0.009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>