22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0909 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  100 
 
 		 259 aa  543  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  66.67 
 
 		 259 aa  386  1e-106  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  53.91 
 
 		 233 aa  279  3e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  52.73 
 
 		 231 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  52.73 
 
 		 231 aa  278  8e-74  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  50 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  50.39 
 
 		 231 aa  259  3e-68  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  51.94 
 
 		 228 aa  250  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  44.19 
 
 		 243 aa  226  3e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  28.94 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  28.82 
 
 		 344 aa  85.1  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  28.82 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  28.45 
 
 		 347 aa  80.5  0.00000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  28.7 
 
 		 458 aa  79.3  0.00000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.85 
 
 		 368 aa  70.9  0.00000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  29.29 
 
 		 144 aa  64.7  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  29.3 
 
 		 157 aa  63.2  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 144 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  27.59 
 
 		 157 aa  62  0.00000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  37.5 
 
 		 156 aa  59.7  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  30.71 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  26.51 
 
 		 453 aa  43.5  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>