49 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_1044 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  100 
 
 
219 aa  461  1e-129  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  54.71 
 
 
229 aa  259  2e-68  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  54.26 
 
 
219 aa  258  4e-68  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  52.91 
 
 
219 aa  256  1e-67  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  52.47 
 
 
219 aa  255  3e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  54.75 
 
 
218 aa  255  3e-67  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  53.42 
 
 
216 aa  254  6e-67  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  49.78 
 
 
219 aa  244  9e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  45.8 
 
 
238 aa  239  2e-62  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  49.78 
 
 
218 aa  236  2e-61  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  50.45 
 
 
217 aa  235  3e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  49.32 
 
 
219 aa  231  5e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  48.86 
 
 
214 aa  231  6e-60  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  48.17 
 
 
220 aa  228  8e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  45.09 
 
 
226 aa  201  8e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  44.8 
 
 
216 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  45.95 
 
 
220 aa  201  9e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  44.8 
 
 
216 aa  201  9e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  44.8 
 
 
216 aa  200  9.999999999999999e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  43.75 
 
 
220 aa  200  1.9999999999999998e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  41.63 
 
 
216 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  48 
 
 
215 aa  189  4e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  39.91 
 
 
216 aa  174  6e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  38.01 
 
 
217 aa  168  7e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  39.8 
 
 
253 aa  163  2.0000000000000002e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  38.99 
 
 
211 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  45 
 
 
214 aa  159  3e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  42.86 
 
 
183 aa  138  7e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  41.96 
 
 
183 aa  135  4e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  42.03 
 
 
425 aa  126  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  35.52 
 
 
443 aa  126  3e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  39.71 
 
 
234 aa  122  3e-27  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  32.48 
 
 
171 aa  112  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  30.83 
 
 
444 aa  111  9e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  33.16 
 
 
435 aa  110  1.0000000000000001e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  32.32 
 
 
181 aa  108  8.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  32.67 
 
 
233 aa  105  4e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  29.22 
 
 
427 aa  106  4e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  32.5 
 
 
171 aa  105  6e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  29.68 
 
 
416 aa  102  4e-21  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  29.39 
 
 
400 aa  102  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  35.11 
 
 
220 aa  67.8  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  29.01 
 
 
179 aa  65.5  0.0000000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  31.96 
 
 
210 aa  63.5  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  26.53 
 
 
211 aa  61.2  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  33.04 
 
 
178 aa  61.2  0.00000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  26.35 
 
 
209 aa  53.9  0.000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  26.52 
 
 
184 aa  52.4  0.000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  22.29 
 
 
340 aa  46.6  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>