79 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_2822 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  100 
 
 		 340 aa  687    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  73.53 
 
 		 340 aa  535  1e-151  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  71.76 
 
 		 340 aa  524  1e-147  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  66.28 
 
 		 340 aa  471  1e-132  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  66.25 
 
 		 343 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  54.87 
 
 		 335 aa  371  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  48.42 
 
 		 337 aa  279  6e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  46.38 
 
 		 330 aa  277  1e-73  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  46.22 
 
 		 330 aa  277  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  48.62 
 
 		 717 aa  273  2.0000000000000002e-72  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  46.51 
 
 		 329 aa  262  4.999999999999999e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  40.76 
 
 		 711 aa  256  3e-67  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  45.03 
 
 		 329 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  45.74 
 
 		 709 aa  246  4.9999999999999997e-64  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  43.08 
 
 		 479 aa  241  2e-62  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  59.34 
 
 		 181 aa  204  2e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  43.4 
 
 		 254 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  43.64 
 
 		 252 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  55.26 
 
 		 102 aa  84.3  0.000000000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  50.67 
 
 		 100 aa  79  0.0000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  31.16 
 
 		 256 aa  77  0.0000000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  29.55 
 
 		 265 aa  70.5  0.00000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  27.88 
 
 		 276 aa  66.6  0.0000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  25.39 
 
 		 277 aa  65.5  0.000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  25.86 
 
 		 580 aa  65.1  0.000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  29.75 
 
 		 266 aa  64.3  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  57.14 
 
 		 102 aa  63.2  0.000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  41.38 
 
 		 160 aa  61.6  0.00000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  25.9 
 
 		 219 aa  60.8  0.00000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  27.57 
 
 		 267 aa  60.5  0.00000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  53.06 
 
 		 102 aa  60.1  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3565  hypothetical protein  23.45 
 
 		 1110 aa  58.2  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  41.89 
 
 		 130 aa  58.2  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.6 
 
 		 655 aa  57.8  0.0000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  24.64 
 
 		 413 aa  58.2  0.0000002  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  49.02 
 
 		 125 aa  56.2  0.0000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  39.29 
 
 		 126 aa  55.8  0.0000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  30.12 
 
 		 220 aa  52.4  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3428  cytochrome C family protein  22.57 
 
 		 1017 aa  52  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.624718  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  50 
 
 		 106 aa  51.2  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2883  cytochrome c family protein  24.58 
 
 		 902 aa  50.1  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  28.02 
 
 		 220 aa  50.1  0.00006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  37.5 
 
 		 199 aa  50.1  0.00006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  24.56 
 
 		 215 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 458 aa  48.5  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  26.71 
 
 		 425 aa  48.9  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  36 
 
 		 350 aa  48.5  0.0002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2884  cytochrome c family protein  24.81 
 
 		 1038 aa  47.8  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  27.7 
 
 		 219 aa  47.8  0.0003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0584  hypothetical protein  25.2 
 
 		 285 aa  47  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0108517  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0479  cytochrome c, putative  27.95 
 
 		 678 aa  46.6  0.0006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  27.87 
 
 		 217 aa  46.6  0.0007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  40.85 
 
 		 112 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2645  hypothetical protein  21.87 
 
 		 867 aa  46.2  0.0009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.519217  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 211 aa  45.8  0.001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2839  cytochrome c family protein  26.12 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000361793  decreased coverage  9.49573e-22 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4477  cytochrome c, putative  25.65 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  26.14 
 
 		 214 aa  45.4  0.001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  27.11 
 
 		 216 aa  45.8  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0482  cytochrome c, putative  26.09 
 
 		 678 aa  45.8  0.001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  30.17 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  25.76 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  30.17 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  23.64 
 
 		 443 aa  44.3  0.003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1152  cytochrome C family protein  24.5 
 
 		 1009 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1124  cytochrome C family protein  24.85 
 
 		 658 aa  44.3  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.932844  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  39.44 
 
 		 112 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  30.83 
 
 		 347 aa  43.9  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2888  hypothetical protein  25.11 
 
 		 1294 aa  43.5  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0493  cytochrome c, putative  25 
 
 		 676 aa  43.5  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  36.84 
 
 		 112 aa  43.5  0.006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1961  cytochrome c family protein  23.59 
 
 		 266 aa  43.5  0.006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  26.24 
 
 		 216 aa  43.1  0.007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  26.62 
 
 		 234 aa  43.1  0.007  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0597  hypothetical protein  24.9 
 
 		 288 aa  43.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000303858 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25 
 
 		 426 aa  42.7  0.009  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  24.24 
 
 		 218 aa  42.7  0.009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  26.24 
 
 		 218 aa  42.7  0.009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  23.38 
 
 		 238 aa  42.7  0.01  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>