56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gdia_0836 on replicon NC_011365
Organism: Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  100 
 
 		 217 aa  451  1.0000000000000001e-126  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  56.76 
 
 		 218 aa  243  1.9999999999999999e-63  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  55.66 
 
 		 219 aa  239  2.9999999999999997e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  50.45 
 
 		 219 aa  235  3e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  55.2 
 
 		 219 aa  235  4e-61  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  52.44 
 
 		 219 aa  233  2.0000000000000002e-60  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  52.29 
 
 		 218 aa  231  6e-60  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  53.33 
 
 		 229 aa  231  6e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  54.09 
 
 		 219 aa  231  6e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  49.77 
 
 		 216 aa  227  9e-59  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  46.22 
 
 		 238 aa  221  9e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  48.17 
 
 		 214 aa  215  2.9999999999999998e-55  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  49.55 
 
 		 220 aa  210  1e-53  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  45.66 
 
 		 219 aa  198  3.9999999999999996e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  44.29 
 
 		 220 aa  195  5.000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  44.59 
 
 		 216 aa  194  8.000000000000001e-49  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  44.5 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  44.5 
 
 		 216 aa  193  1e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  43.58 
 
 		 216 aa  191  5e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  44.04 
 
 		 216 aa  189  2e-47  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  47.37 
 
 		 226 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  46.05 
 
 		 220 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  48 
 
 		 215 aa  179  4e-44  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  40.55 
 
 		 211 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  40.62 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  41.8 
 
 		 253 aa  157  1e-37  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  40 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  37.7 
 
 		 234 aa  133  1.9999999999999998e-30  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  37.36 
 
 		 425 aa  127  1.0000000000000001e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  42.42 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  43.18 
 
 		 183 aa  127  1.0000000000000001e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  32.76 
 
 		 443 aa  124  9e-28  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  30.37 
 
 		 435 aa  112  3e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  31.61 
 
 		 444 aa  107  2e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  31.12 
 
 		 427 aa  106  3e-22  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  30.25 
 
 		 181 aa  100  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  31.29 
 
 		 171 aa  99.8  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  27.54 
 
 		 416 aa  95.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  31.12 
 
 		 233 aa  95.1  8e-19  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  36.89 
 
 		 171 aa  93.2  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  26.25 
 
 		 400 aa  90.9  1e-17  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  30.18 
 
 		 179 aa  77.8  0.0000000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  29.31 
 
 		 210 aa  74.7  0.000000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  30.99 
 
 		 220 aa  72.8  0.000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  28.74 
 
 		 211 aa  71.2  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  28.9 
 
 		 209 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  29.27 
 
 		 178 aa  63.2  0.000000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  29.66 
 
 		 184 aa  60.8  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 340 aa  48.9  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  27.87 
 
 		 340 aa  46.6  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1440  hypothetical protein  27.66 
 
 		 413 aa  45.1  0.0007  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00370181  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 458 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  25.55 
 
 		 426 aa  42.7  0.004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 711 aa  42.4  0.005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0267  hypothetical protein  28.87 
 
 		 202 aa  42.4  0.006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000377506  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  30.77 
 
 		 335 aa  41.6  0.01  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>