22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_1838 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  100 
 
 		 157 aa  325  2.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  58.17 
 
 		 157 aa  211  2.9999999999999995e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  41.67 
 
 		 144 aa  125  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  41.67 
 
 		 144 aa  124  4.0000000000000003e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  43.22 
 
 		 156 aa  109  1.0000000000000001e-23  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  36.15 
 
 		 143 aa  102  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  34.86 
 
 		 344 aa  72  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  35.77 
 
 		 347 aa  71.6  0.000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  33.94 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  33.94 
 
 		 344 aa  68.9  0.00000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  28.77 
 
 		 233 aa  62.4  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  27.59 
 
 		 259 aa  62  0.000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  28.86 
 
 		 231 aa  60.5  0.000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  28 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  28 
 
 		 231 aa  57.8  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  25.89 
 
 		 368 aa  57.4  0.00000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  26.03 
 
 		 259 aa  56.2  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  25.85 
 
 		 231 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  29.51 
 
 		 228 aa  53.9  0.0000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  29.63 
 
 		 243 aa  53.5  0.000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  27.74 
 
 		 154 aa  43.9  0.001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  28.23 
 
 		 458 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>