40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_3392 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  98.26 
 
 
344 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  99.42 
 
 
344 aa  700    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  100 
 
 
344 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  52.52 
 
 
347 aa  347  2e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  34.38 
 
 
368 aa  160  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  32.05 
 
 
458 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  32.54 
 
 
231 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  31.6 
 
 
228 aa  97.8  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  30.95 
 
 
231 aa  96.3  8e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  31.31 
 
 
233 aa  94.7  2e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  29.69 
 
 
231 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  29.69 
 
 
231 aa  94.4  3e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  29.92 
 
 
259 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  32.42 
 
 
243 aa  89.7  7e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  28.82 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  35.83 
 
 
157 aa  81.3  0.00000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  40.91 
 
 
143 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  37.27 
 
 
156 aa  70.1  0.00000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  35.14 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  35.14 
 
 
144 aa  69.7  0.00000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  33.94 
 
 
157 aa  69.3  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  27.66 
 
 
337 aa  64.7  0.000000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  26.51 
 
 
329 aa  62.4  0.00000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  27.57 
 
 
329 aa  58.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.52 
 
 
335 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  25.53 
 
 
340 aa  55.1  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  26.64 
 
 
254 aa  53.9  0.000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.93 
 
 
717 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  25.32 
 
 
709 aa  52  0.00002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  25.41 
 
 
711 aa  50.8  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  25.68 
 
 
147 aa  50.1  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.13 
 
 
330 aa  48.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  25.44 
 
 
453 aa  48.1  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  24.53 
 
 
154 aa  47.4  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  24.66 
 
 
340 aa  47.4  0.0004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  27.47 
 
 
253 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  24.4 
 
 
330 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.48 
 
 
639 aa  46.2  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  23.3 
 
 
479 aa  45.1  0.002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  26.67 
 
 
215 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>