53 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1703 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  100 
 
 		 337 aa  681    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  52.99 
 
 		 335 aa  310  2e-83  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  49.85 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  49.56 
 
 		 329 aa  304  1.0000000000000001e-81  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  47.77 
 
 		 330 aa  295  7e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  47.93 
 
 		 330 aa  293  2e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  44.12 
 
 		 479 aa  290  2e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  50 
 
 		 340 aa  288  1e-76  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  50.14 
 
 		 340 aa  286  4e-76  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  48.42 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  46.42 
 
 		 340 aa  254  2.0000000000000002e-66  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  52.57 
 
 		 254 aa  253  2.0000000000000002e-66  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1996  cytochrome c family protein  46.01 
 
 		 343 aa  249  5e-65  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00379729  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  45.54 
 
 		 717 aa  245  6.999999999999999e-64  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  41.67 
 
 		 711 aa  231  2e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  45.45 
 
 		 709 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1102  cytochrome c family protein  44.31 
 
 		 252 aa  200  3e-50  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.000000169196  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1385  hypothetical protein  40.99 
 
 		 181 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.522055  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0469  hypothetical protein  52.63 
 
 		 102 aa  76.3  0.0000000000007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3996  hypothetical protein  30.85 
 
 		 256 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000934888  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1433  hypothetical protein  39.47 
 
 		 106 aa  64.7  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000304955  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  23.83 
 
 		 655 aa  64.7  0.000000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3997  hypothetical protein  25.61 
 
 		 265 aa  63.9  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000400018  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  27.86 
 
 		 344 aa  62.4  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  29.76 
 
 		 344 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  28.24 
 
 		 344 aa  62  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2745  hypothetical protein  25 
 
 		 276 aa  61.2  0.00000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000727433  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1082  hypothetical protein  27.03 
 
 		 266 aa  60.5  0.00000004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.15012e-18 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1150  hypothetical protein  46.77 
 
 		 100 aa  59.3  0.00000008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00196806  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3254  hypothetical protein  23.89 
 
 		 267 aa  58.9  0.0000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000163146  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1146  hypothetical protein  27.83 
 
 		 426 aa  57  0.0000004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.00972968  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0729  hypothetical protein  38.53 
 
 		 102 aa  53.5  0.000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000019285 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3348  hypothetical protein  38.67 
 
 		 126 aa  53.5  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000670369  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0716  hypothetical protein  38.53 
 
 		 102 aa  53.1  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.824406  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1874  hypothetical protein  42.86 
 
 		 112 aa  52.8  0.000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4130  cytochrome c class I  38.81 
 
 		 350 aa  52  0.00001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1803  hypothetical protein  34.09 
 
 		 113 aa  52.4  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.20863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1084  hypothetical protein  24.65 
 
 		 277 aa  52  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.18348e-17 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  23.99 
 
 		 347 aa  51.6  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2767  hypothetical protein  33.78 
 
 		 125 aa  51.2  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000252598  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4131  hypothetical protein  35.38 
 
 		 160 aa  50.8  0.00003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2004  hypothetical protein  38.36 
 
 		 112 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1959  hypothetical protein  41.43 
 
 		 112 aa  49.3  0.00009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.563313  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4126  hypothetical protein  38.46 
 
 		 130 aa  48.9  0.0001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.686077 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0523  cytochrome c family protein  27.44 
 
 		 259 aa  47.4  0.0003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.149133 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4127  hypothetical protein  33.78 
 
 		 199 aa  46.2  0.0009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.878957 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0670  cytochrome c family protein  22.98 
 
 		 284 aa  45.1  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000144987  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  25 
 
 		 884 aa  44.7  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  23.92 
 
 		 580 aa  44.3  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2598  cytochrome c class III  25.59 
 
 		 556 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  23.61 
 
 		 220 aa  43.5  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  21.52 
 
 		 806 aa  43.1  0.006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0742  hypothetical protein  25.49 
 
 		 563 aa  42.7  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.345511 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>