20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1291 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  100 
 
 
147 aa  303  6e-82  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  29.75 
 
 
453 aa  55.1  0.0000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  29.93 
 
 
228 aa  52.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  26.35 
 
 
344 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  28.93 
 
 
243 aa  50.8  0.000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  29.7 
 
 
231 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  29.7 
 
 
231 aa  50.8  0.000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  25.68 
 
 
344 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.68 
 
 
344 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  26.49 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  30.12 
 
 
154 aa  47.8  0.00004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  29 
 
 
231 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  25.74 
 
 
233 aa  46.2  0.0001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  32.22 
 
 
368 aa  45.8  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  27 
 
 
231 aa  45.1  0.0003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  24.53 
 
 
144 aa  43.5  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  26.17 
 
 
458 aa  43.5  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  21.58 
 
 
259 aa  42  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  23.9 
 
 
144 aa  42.7  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  27.96 
 
 
259 aa  41.2  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>