24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_2294 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  100 
 
 
243 aa  509  1e-143  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  57.55 
 
 
231 aa  295  3e-79  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  56.33 
 
 
231 aa  292  3e-78  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  56.5 
 
 
233 aa  288  4e-77  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  57.14 
 
 
231 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  57.14 
 
 
231 aa  285  5e-76  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  57.71 
 
 
228 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  44.4 
 
 
259 aa  241  6e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  44.19 
 
 
259 aa  226  3e-58  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  32.42 
 
 
344 aa  89.7  4e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  30.47 
 
 
347 aa  89.4  5e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  31.87 
 
 
344 aa  88.6  9e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  31.87 
 
 
344 aa  87.8  1e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.22 
 
 
368 aa  75.9  0.0000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  29.89 
 
 
458 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  33.65 
 
 
144 aa  58.9  0.00000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  33.65 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  28.47 
 
 
143 aa  55.8  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  30.43 
 
 
156 aa  54.7  0.000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  27.5 
 
 
157 aa  54.7  0.000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  29.63 
 
 
157 aa  53.5  0.000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  28.93 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  24.87 
 
 
453 aa  43.1  0.004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  26.32 
 
 
154 aa  42  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>