23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2738 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  100 
 
 
231 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  100 
 
 
231 aa  488  1e-137  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  71.86 
 
 
231 aa  362  2e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  69.7 
 
 
231 aa  358  4e-98  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  68.97 
 
 
233 aa  348  3e-95  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  69.7 
 
 
228 aa  314  8e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  57.14 
 
 
243 aa  285  5e-76  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  54.69 
 
 
259 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  52.73 
 
 
259 aa  278  7e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  31.96 
 
 
347 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  29.69 
 
 
344 aa  93.6  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  28.19 
 
 
344 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  34.43 
 
 
368 aa  86.3  4e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  29.53 
 
 
458 aa  78.6  0.00000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  28 
 
 
157 aa  57.8  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  28.28 
 
 
144 aa  55.1  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  24.14 
 
 
344 aa  55.1  0.0000009  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  29.93 
 
 
144 aa  55.1  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  27.63 
 
 
157 aa  53.9  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  34.04 
 
 
156 aa  52  0.000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  34.04 
 
 
143 aa  51.6  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  29.7 
 
 
147 aa  50.8  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  30.84 
 
 
154 aa  42.4  0.006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>