14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_2718 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  100 
 
 		 453 aa  894    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  29.3 
 
 		 458 aa  79  0.0000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  25.19 
 
 		 347 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  29.75 
 
 		 147 aa  54.7  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.1 
 
 		 368 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  25.37 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  25.44 
 
 		 344 aa  48.1  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2405  cytochrome c, class III  24.11 
 
 		 545 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0444659 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  25.37 
 
 		 344 aa  47.8  0.0004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2720  hypothetical protein  25.82 
 
 		 580 aa  46.2  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.44099 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.21 
 
 		 806 aa  43.5  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  26.51 
 
 		 154 aa  43.5  0.008  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  24.87 
 
 		 243 aa  43.5  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  26.51 
 
 		 259 aa  43.1  0.01  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>