17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MCA0428 on replicon NC_002977
Organism: Methylococcus capsulatus str. Bath



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  100 
 
 		 154 aa  322  1e-87  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  30.7 
 
 		 347 aa  52.4  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  33.33 
 
 		 458 aa  50.4  0.000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  28.29 
 
 		 231 aa  48.9  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  28.29 
 
 		 231 aa  48.9  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  24.53 
 
 		 344 aa  48.1  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  30.12 
 
 		 147 aa  47.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  24.53 
 
 		 344 aa  47.4  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  24.53 
 
 		 344 aa  47.4  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  27.78 
 
 		 233 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  31.19 
 
 		 259 aa  46.2  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  27.74 
 
 		 157 aa  43.9  0.0009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  26.51 
 
 		 453 aa  43.1  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  30.84 
 
 		 231 aa  42.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  26.32 
 
 		 243 aa  42  0.003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  30.3 
 
 		 368 aa  40.8  0.006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>