23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0992 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  100 
 
 
259 aa  541  1e-153  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  66.67 
 
 
259 aa  386  1e-106  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  57.42 
 
 
233 aa  298  5e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  54.69 
 
 
231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  54.69 
 
 
231 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  51.95 
 
 
231 aa  279  3e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  51.17 
 
 
231 aa  276  2e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  52.73 
 
 
228 aa  266  2e-70  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  44.4 
 
 
243 aa  241  7e-63  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  29.92 
 
 
344 aa  94  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  29.92 
 
 
344 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  29.92 
 
 
344 aa  93.2  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  30.88 
 
 
347 aa  92  9e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.5 
 
 
368 aa  72.8  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  28.47 
 
 
144 aa  65.1  0.000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  28.28 
 
 
144 aa  62.8  0.000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  27.44 
 
 
458 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  26.03 
 
 
157 aa  56.2  0.0000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  30.97 
 
 
156 aa  52.4  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  26.11 
 
 
157 aa  51.2  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  32 
 
 
143 aa  48.9  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  31.19 
 
 
154 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  21.58 
 
 
147 aa  42  0.009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>