23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0988 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  100 
 
 		 233 aa  489  1e-137  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  73.82 
 
 		 231 aa  379  1e-104  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  72.96 
 
 		 231 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  68.97 
 
 		 231 aa  348  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  68.97 
 
 		 231 aa  348  3e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  57.42 
 
 		 259 aa  298  4e-80  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  56.5 
 
 		 243 aa  288  4e-77  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  62.07 
 
 		 228 aa  282  3.0000000000000004e-75  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  53.91 
 
 		 259 aa  279  3e-74  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  34.39 
 
 		 347 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  31.31 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  31.31 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  30.84 
 
 		 344 aa  92.4  5e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  32.22 
 
 		 368 aa  92  6e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  28.91 
 
 		 458 aa  75.9  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  31.21 
 
 		 157 aa  65.5  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  28.77 
 
 		 157 aa  62.4  0.000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 144 aa  59.7  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  30.34 
 
 		 144 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  31.54 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  34.41 
 
 		 156 aa  53.1  0.000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  25.74 
 
 		 147 aa  46.2  0.0004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  27.78 
 
 		 154 aa  46.2  0.0005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>