41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene A2cp1_3539 on replicon NC_011891
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  100 
 
 		 344 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  98.84 
 
 		 344 aa  695    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  98.26 
 
 		 344 aa  692    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  52.23 
 
 		 347 aa  345  8e-94  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  34.38 
 
 		 368 aa  161  2e-38  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  32.05 
 
 		 458 aa  104  2e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  32.54 
 
 		 231 aa  99.8  7e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  31.6 
 
 		 228 aa  95.9  8e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  29.33 
 
 		 231 aa  94.7  2e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  29.92 
 
 		 259 aa  94  4e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  31.48 
 
 		 233 aa  92.8  8e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  31.87 
 
 		 243 aa  88.6  1e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  28.94 
 
 		 259 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  40.91 
 
 		 143 aa  79.7  0.00000000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  35 
 
 		 157 aa  79  0.0000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  34.86 
 
 		 157 aa  72  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  37.27 
 
 		 156 aa  70.9  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  34.23 
 
 		 144 aa  66.2  0.0000000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  34.23 
 
 		 144 aa  65.9  0.0000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  28.89 
 
 		 337 aa  64.3  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0592  cytochrome c family protein  26.05 
 
 		 329 aa  61.6  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.000257113  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  25.8 
 
 		 340 aa  58.9  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  27.52 
 
 		 335 aa  57  0.0000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  27.1 
 
 		 329 aa  57  0.0000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 231 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 231 aa  53.1  0.000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3135  hypothetical protein  23.87 
 
 		 717 aa  52.8  0.000009  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3655  hypothetical protein  26.36 
 
 		 254 aa  52.4  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  26.35 
 
 		 147 aa  52  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.47 
 
 		 340 aa  50.8  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2301  cytochrome c family protein  26.34 
 
 		 709 aa  50.8  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  24.86 
 
 		 711 aa  48.9  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0679  cytochrome c family protein  25.4 
 
 		 330 aa  48.5  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  25.44 
 
 		 453 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  24.53 
 
 		 154 aa  48.1  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1780  decaheme cytochrome c MtrF  24.48 
 
 		 639 aa  46.6  0.0007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1575  cytochrome c family protein  23.71 
 
 		 479 aa  44.3  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0692  cytochrome c family protein  32.41 
 
 		 330 aa  43.5  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000351861 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1744  cytochrome c family protein  26.02 
 
 		 337 aa  43.9  0.005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.740978 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  25.56 
 
 		 215 aa  43.1  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>