24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3380 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  100 
 
 		 231 aa  484  1e-136  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  95.67 
 
 		 231 aa  471  1e-132  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  73.82 
 
 		 233 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  71.86 
 
 		 231 aa  362  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  71.86 
 
 		 231 aa  362  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  57.55 
 
 		 243 aa  295  3e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  51.95 
 
 		 259 aa  279  2e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  62.1 
 
 		 228 aa  271  9e-72  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  50.39 
 
 		 259 aa  259  2e-68  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  33.79 
 
 		 347 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  30.95 
 
 		 344 aa  95.9  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  29.33 
 
 		 344 aa  94.4  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  29.33 
 
 		 344 aa  94.4  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  32.52 
 
 		 368 aa  88.2  1e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  26.36 
 
 		 458 aa  75.1  0.0000000000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  28.86 
 
 		 157 aa  60.5  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 144 aa  58.9  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 157 aa  57.8  0.0000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  32.31 
 
 		 143 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  29.58 
 
 		 144 aa  57  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  31.53 
 
 		 156 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0428  hypothetical protein  28.29 
 
 		 154 aa  48.9  0.00007  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  27 
 
 		 147 aa  45.1  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  27.78 
 
 		 463 aa  43.9  0.002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>