22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0912 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  100 
 
 		 228 aa  476  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  69.7 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  69.7 
 
 		 231 aa  329  2e-89  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  61.9 
 
 		 233 aa  292  2e-78  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  59.91 
 
 		 231 aa  278  7e-74  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  52.73 
 
 		 259 aa  277  9e-74  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  59.48 
 
 		 231 aa  275  3e-73  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  56.38 
 
 		 243 aa  268  5e-71  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  52.33 
 
 		 259 aa  263  1e-69  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  34.7 
 
 		 347 aa  107  2e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  31.6 
 
 		 344 aa  97.8  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  31.17 
 
 		 344 aa  96.7  3e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  31.6 
 
 		 344 aa  95.9  4e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  32.67 
 
 		 368 aa  89.4  5e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  27.6 
 
 		 458 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  30.28 
 
 		 157 aa  62.8  0.000000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  32.59 
 
 		 144 aa  60.8  0.00000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  32.59 
 
 		 144 aa  60.5  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  28.79 
 
 		 157 aa  57.4  0.0000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  29.93 
 
 		 147 aa  53.1  0.000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 156 aa  52  0.000008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  34.41 
 
 		 143 aa  50.8  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>