21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0827 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  100 
 
 		 156 aa  326  6e-89  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  76.22 
 
 		 143 aa  245  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  43.67 
 
 		 157 aa  122  1e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  37.82 
 
 		 157 aa  112  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  36.77 
 
 		 144 aa  98.2  3e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  36.13 
 
 		 144 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  37.27 
 
 		 344 aa  70.9  0.000000000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  37.27 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  37.27 
 
 		 344 aa  70.1  0.00000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  35.45 
 
 		 347 aa  65.1  0.0000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  32.28 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  28.67 
 
 		 231 aa  58.9  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  31.01 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  31.01 
 
 		 231 aa  57.4  0.00000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  29.3 
 
 		 243 aa  57  0.00000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  29.49 
 
 		 233 aa  54.3  0.0000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  27.59 
 
 		 231 aa  53.9  0.0000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  30.97 
 
 		 259 aa  52.4  0.000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  36.25 
 
 		 228 aa  52  0.000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  29.67 
 
 		 368 aa  49.7  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  32.95 
 
 		 458 aa  46.6  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>