23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0873 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0873  cytochrome c family protein  100 
 
 		 144 aa  302  9.000000000000001e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.301759 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3373  cytochrome c family protein  97.92 
 
 		 144 aa  299  7.000000000000001e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2725  cytochrome c family protein  45.57 
 
 		 157 aa  131  3e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1838  hypothetical protein  41.67 
 
 		 157 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000686473  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2643  cytochrome c family protein  41.28 
 
 		 143 aa  89.4  2e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0827  cytochrome c family protein  38.53 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.016185 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  35.14 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  35.14 
 
 		 344 aa  69.3  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  36.04 
 
 		 347 aa  67.4  0.00000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  34.23 
 
 		 344 aa  65.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0992  hypothetical protein  28.28 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.210386  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0909  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.427624 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2294  hypothetical protein  33.65 
 
 		 243 aa  58.9  0.00000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0988  hypothetical protein  30.34 
 
 		 233 aa  57.8  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.702394  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3380  hypothetical protein  29.58 
 
 		 231 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.419565  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  31.25 
 
 		 368 aa  57  0.00000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0866  hypothetical protein  29.08 
 
 		 231 aa  56.6  0.0000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2738  cytochrome c family protein  29.93 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2732  cytochrome c family protein  29.93 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0912  cytochrome c family protein  32.29 
 
 		 228 aa  54.3  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  36.62 
 
 		 458 aa  45.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1291  hypothetical protein  24.53 
 
 		 147 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2718  hypothetical protein  29.63 
 
 		 453 aa  42.7  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.412382 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>