52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcar_2550 on replicon NC_007498
Organism: Pelobacter carbinolicus DSM 2380



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  100 
 
 		 181 aa  374  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  44.78 
 
 		 171 aa  139  3e-32  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  47.76 
 
 		 171 aa  136  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  37.25 
 
 		 443 aa  133  1.9999999999999998e-30  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  39.61 
 
 		 425 aa  131  5e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  35.26 
 
 		 435 aa  125  4.0000000000000003e-28  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  32.54 
 
 		 220 aa  122  3e-27  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  42.03 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  42.03 
 
 		 183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  34.48 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  37.86 
 
 		 219 aa  118  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  35.8 
 
 		 219 aa  117  6e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  37.86 
 
 		 219 aa  117  7.999999999999999e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  37.11 
 
 		 218 aa  117  9.999999999999999e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  33.33 
 
 		 400 aa  115  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  38.36 
 
 		 214 aa  116  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  28.64 
 
 		 444 aa  115  3e-25  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32 
 
 		 416 aa  115  3.9999999999999997e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  37.14 
 
 		 219 aa  115  3.9999999999999997e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  35.44 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  35.44 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  35.44 
 
 		 216 aa  115  3.9999999999999997e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  40.17 
 
 		 211 aa  114  6e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  36.25 
 
 		 229 aa  113  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  34.39 
 
 		 220 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  33.75 
 
 		 214 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  30.06 
 
 		 253 aa  112  2.0000000000000002e-24  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  36.71 
 
 		 216 aa  113  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  33.1 
 
 		 215 aa  112  3e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  39.17 
 
 		 216 aa  110  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  38.69 
 
 		 218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  37.18 
 
 		 238 aa  110  1.0000000000000001e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  32.32 
 
 		 219 aa  108  5e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  29.61 
 
 		 427 aa  108  6e-23  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  33.77 
 
 		 233 aa  108  6e-23  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  31.07 
 
 		 217 aa  105  3e-22  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  30.72 
 
 		 220 aa  101  5e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  30.25 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  32.28 
 
 		 216 aa  99.4  2e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  29.52 
 
 		 226 aa  96.3  2e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  32.02 
 
 		 234 aa  95.1  4e-19  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  30 
 
 		 179 aa  85.1  6e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  31.95 
 
 		 178 aa  77.4  0.0000000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  26.53 
 
 		 220 aa  67  0.0000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  23.95 
 
 		 184 aa  60.1  0.00000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  29.29 
 
 		 210 aa  59.3  0.00000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  24.18 
 
 		 211 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  25.81 
 
 		 209 aa  57.4  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  27.01 
 
 		 347 aa  44.3  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3578  cytochrome c family protein  34.29 
 
 		 458 aa  42.7  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.628183  normal  0.0456283 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1315  hypothetical protein  28.74 
 
 		 335 aa  42  0.004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000524828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28.17 
 
 		 368 aa  40.8  0.01  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>