57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3982 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  100 
 
 		 253 aa  531  1e-150  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  51.53 
 
 		 215 aa  250  1e-65  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  43.11 
 
 		 217 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  41.9 
 
 		 216 aa  195  5.000000000000001e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  45.45 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  45.45 
 
 		 216 aa  193  2e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  45 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  44.24 
 
 		 219 aa  191  7e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  43.78 
 
 		 219 aa  190  2e-47  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  43.78 
 
 		 219 aa  189  4e-47  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  42.24 
 
 		 218 aa  188  7e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  42.66 
 
 		 220 aa  187  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  43.38 
 
 		 220 aa  186  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  42.4 
 
 		 219 aa  184  9e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  42.86 
 
 		 219 aa  182  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  42.6 
 
 		 229 aa  181  7e-45  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  42.2 
 
 		 218 aa  181  8.000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  41.59 
 
 		 216 aa  181  1e-44  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  43.66 
 
 		 211 aa  179  2.9999999999999997e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  40.37 
 
 		 214 aa  178  9e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  40.91 
 
 		 220 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  41.36 
 
 		 226 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  37.92 
 
 		 238 aa  174  9.999999999999999e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  39.8 
 
 		 219 aa  163  3e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  40.36 
 
 		 216 aa  163  3e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  41.8 
 
 		 217 aa  157  1e-37  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  38.89 
 
 		 425 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  36.36 
 
 		 234 aa  146  4.0000000000000006e-34  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  40.26 
 
 		 443 aa  144  2e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  33.96 
 
 		 435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  32.92 
 
 		 416 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  33.98 
 
 		 444 aa  131  9e-30  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  39.63 
 
 		 233 aa  129  4.0000000000000003e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  37.56 
 
 		 214 aa  129  4.0000000000000003e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  35.94 
 
 		 427 aa  129  5.0000000000000004e-29  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  35.84 
 
 		 400 aa  116  3e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  30.26 
 
 		 183 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  30.06 
 
 		 181 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  34.78 
 
 		 183 aa  110  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  30.23 
 
 		 171 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  28.07 
 
 		 171 aa  99  7e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  30.67 
 
 		 220 aa  74.7  0.000000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  33.64 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  28.65 
 
 		 179 aa  65.5  0.0000000008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  32.71 
 
 		 211 aa  63.2  0.000000004  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  30.56 
 
 		 209 aa  55.8  0.0000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  28.31 
 
 		 184 aa  54.3  0.000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2960  cytochrome  24.45 
 
 		 577 aa  49.3  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.992406  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  27.75 
 
 		 178 aa  49.3  0.00007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0817  cytochrome C family protein  24.41 
 
 		 540 aa  48.5  0.00009  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6280  hypothetical protein  28 
 
 		 368 aa  48.1  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3539  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.974857  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3475  hypothetical protein  28.57 
 
 		 344 aa  47.8  0.0002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3392  hypothetical protein  27.47 
 
 		 344 aa  46.6  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  25.24 
 
 		 711 aa  43.9  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  28.14 
 
 		 615 aa  42.4  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  28.67 
 
 		 340 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>