56 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0159 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  100 
 
 
219 aa  457  9.999999999999999e-129  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  98.17 
 
 
219 aa  449  1e-125  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  94.06 
 
 
219 aa  433  1e-121  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  79.91 
 
 
219 aa  375  1e-103  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  72.48 
 
 
218 aa  337  5.9999999999999996e-92  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  71.23 
 
 
229 aa  337  9.999999999999999e-92  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  68.95 
 
 
218 aa  324  6e-88  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  56.16 
 
 
216 aa  275  5e-73  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  52.47 
 
 
219 aa  255  3e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  50.21 
 
 
238 aa  251  7e-66  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  55.66 
 
 
217 aa  239  2.9999999999999997e-62  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  54.05 
 
 
214 aa  237  8e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  47.95 
 
 
219 aa  233  1.0000000000000001e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  48.86 
 
 
216 aa  229  4e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  50 
 
 
220 aa  228  5e-59  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  49.77 
 
 
216 aa  227  1e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  49.77 
 
 
216 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  49.77 
 
 
216 aa  226  3e-58  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  51.8 
 
 
220 aa  226  3e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  50.67 
 
 
226 aa  222  3e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  48.42 
 
 
220 aa  221  7e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  51.23 
 
 
216 aa  214  9e-55  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  48.15 
 
 
215 aa  201  6e-51  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  44.24 
 
 
253 aa  191  6e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  41.74 
 
 
211 aa  177  9e-44  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  41.4 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  42.6 
 
 
214 aa  169  4e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  43.61 
 
 
425 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  43.07 
 
 
443 aa  137  1e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  41.61 
 
 
234 aa  131  1.0000000000000001e-29  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  37.71 
 
 
233 aa  126  2.0000000000000002e-28  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  35.35 
 
 
435 aa  124  1e-27  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  43.44 
 
 
183 aa  123  2e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  36.47 
 
 
444 aa  122  5e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  42.62 
 
 
183 aa  120  9.999999999999999e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  37.86 
 
 
181 aa  118  7e-26  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  38 
 
 
427 aa  115  3e-25  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  38.82 
 
 
171 aa  114  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  33.51 
 
 
400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  38.31 
 
 
416 aa  112  4.0000000000000004e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  35.44 
 
 
171 aa  109  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  33.33 
 
 
210 aa  76.6  0.0000000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  31.34 
 
 
211 aa  70.9  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  38.61 
 
 
220 aa  70.9  0.00000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  31.01 
 
 
209 aa  65.1  0.0000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  33.86 
 
 
178 aa  62  0.000000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  28.57 
 
 
179 aa  61.2  0.00000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  32.41 
 
 
184 aa  57.8  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  29.79 
 
 
347 aa  45.8  0.0005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2822  hypothetical protein  30.17 
 
 
340 aa  45.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000171082  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  23.58 
 
 
711 aa  43.5  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2048  cytochrome c family protein  25.38 
 
 
340 aa  43.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  2.36956e-16  hitchhiker  0.000000028762 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1900  hypothetical protein  24.26 
 
 
340 aa  42.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.857082 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2323  hypothetical protein  25.25 
 
 
340 aa  42.7  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000105852  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2930  cytochrome c family protein  28.03 
 
 
329 aa  42  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000304572  decreased coverage  8.81711e-19 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3125  decaheme cytochrome c  30 
 
 
667 aa  41.6  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00001045  hitchhiker  0.00000606277 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>