54 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RoseRS_4139 on replicon NC_009523
Organism: Roseiflexus sp. RS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_4139  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  462  1e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1462  hypothetical protein  93.64 
 
 		 226 aa  441  1e-123  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0873129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3387  hypothetical protein  58.3 
 
 		 219 aa  268  4e-71  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1596  chaperone protein HtpG  54.75 
 
 		 216 aa  259  3e-68  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1525  hypothetical protein  50.45 
 
 		 220 aa  235  4e-61  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.415046  normal  1 
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4188  chaperone protein HtpG  48.42 
 
 		 218 aa  222  3e-57  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0159  chaperone protein HtpG  48.42 
 
 		 219 aa  221  7e-57  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0899507  hitchhiker  0.00859507 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5825  chaperone protein HtpG  50.23 
 
 		 218 aa  219  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.024458  normal  0.0728154 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0017  chaperone protein HtpG  48.42 
 
 		 219 aa  218  6e-56  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.247503  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0215  chaperone protein HtpG  47.51 
 
 		 219 aa  215  4e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.391907  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6894  chaperone protein HtpG  47.96 
 
 		 229 aa  214  5.9999999999999996e-55  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810748  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6222  chaperone protein HtpG  47.53 
 
 		 219 aa  213  1.9999999999999998e-54  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.385965  decreased coverage  0.00955528 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3004  chaperone protein HtpG  44.17 
 
 		 238 aa  213  2.9999999999999995e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000955215 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1237  chaperone protein HtpG  45.7 
 
 		 214 aa  211  1e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.250059  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1044  chaperone protein HtpG  43.75 
 
 		 219 aa  200  1.9999999999999998e-50  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.887318  normal  0.440789 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0221  cytochrome c family protein  44.09 
 
 		 211 aa  197  7e-50  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0843  hypothetical protein  43.3 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.319857  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0847  hypothetical protein  43.3 
 
 		 216 aa  192  4e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.554273  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0840  hypothetical protein  43.3 
 
 		 216 aa  191  6e-48  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.373903  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0795  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  190  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0836  putative chaperone protein HtpG  46.05 
 
 		 217 aa  189  2.9999999999999997e-47  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.199398  normal  0.167985 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5956  chaperone protein HtpG  42.86 
 
 		 220 aa  183  2.0000000000000003e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.387294  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3982  cytochrome c family protein  40.91 
 
 		 253 aa  176  2e-43  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.520648  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3935  cytochrome c family protein  40.71 
 
 		 217 aa  172  2.9999999999999996e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.442182  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4427  chaperone protein HtpG  39.82 
 
 		 216 aa  172  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.859457  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2412  cytochrome c family protein  41.95 
 
 		 215 aa  169  3e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.163467  normal  0.409257 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2714  hypothetical protein  37.12 
 
 		 214 aa  140  1.9999999999999998e-32  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.272646  normal  0.284097 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5664  cytochrome c class I  40.15 
 
 		 443 aa  115  3.9999999999999997e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.239336  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1215  putative cytochrome c  31.91 
 
 		 234 aa  114  1.0000000000000001e-24  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.422839  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3477  cytochrome c class I  41.32 
 
 		 425 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.333881  normal  0.501976 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2213  cytochrome c, mono- and diheme variant  35.75 
 
 		 435 aa  109  3e-23  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1426  membrane protein containing cytochrome c domain protein  31.39 
 
 		 233 aa  106  3e-22  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2550  cytochrome c family protein  30.72 
 
 		 181 aa  101  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.250685  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0529  cytochrome c class I  32.79 
 
 		 400 aa  100  2e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1809  hypothetical protein  35.62 
 
 		 171 aa  99.4  4e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0786634  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0103  hypothetical protein  35.56 
 
 		 183 aa  98.6  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00108183 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01315  Cytochrome c3  29.44 
 
 		 427 aa  97.8  1e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0122  hypothetical protein  33.78 
 
 		 183 aa  96.7  2e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1634  cytochrome c, class I  34.48 
 
 		 444 aa  97.1  2e-19  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0288  cytochrome c class I  30.5 
 
 		 416 aa  95.1  7e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.142751  normal  0.0801636 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2778  hypothetical protein  33.61 
 
 		 171 aa  85.9  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2690  hypothetical protein  27.68 
 
 		 211 aa  68.9  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0297464 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2546  hypothetical protein  32.84 
 
 		 220 aa  68.6  0.00000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000133101  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2268  hypothetical protein  33.07 
 
 		 210 aa  67.4  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0270  hypothetical protein  26.63 
 
 		 178 aa  58.5  0.00000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0149554  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2932  hypothetical protein  26.11 
 
 		 209 aa  57.8  0.0000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3390  hypothetical protein  22.35 
 
 		 179 aa  55.5  0.0000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0611  hypothetical protein  24.32 
 
 		 184 aa  50.4  0.00002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.295939  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2210  cytochrome c family protein  31.03 
 
 		 711 aa  49.3  0.00004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0305  cytochrome c class III  24.85 
 
 		 225 aa  45.1  0.0008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.936992  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1703  cytochrome c family protein  23.61 
 
 		 337 aa  43.5  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  27.97 
 
 		 618 aa  43.5  0.003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  27.97 
 
 		 626 aa  42.4  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3457  hypothetical protein  22.31 
 
 		 347 aa  42  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434571 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>