20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4118 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  63.78 
 
 		 657 aa  819    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  65.06 
 
 		 631 aa  808    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  100 
 
 		 618 aa  1289    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  95.63 
 
 		 626 aa  1214    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  58.67 
 
 		 620 aa  756    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  76.86 
 
 		 620 aa  983    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  29.68 
 
 		 620 aa  243  6e-63  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.93 
 
 		 790 aa  185  2.0000000000000003e-45  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  26.43 
 
 		 709 aa  166  1.0000000000000001e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  22.63 
 
 		 949 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  24.58 
 
 		 412 aa  58.2  0.0000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  24.86 
 
 		 1432 aa  53.9  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  26.81 
 
 		 418 aa  52.8  0.00002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  24.89 
 
 		 1532 aa  52.4  0.00002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  26.81 
 
 		 418 aa  53.1  0.00002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  22.99 
 
 		 1344 aa  50.8  0.00007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  23.68 
 
 		 414 aa  49.3  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  27.82 
 
 		 417 aa  45.1  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  35.06 
 
 		 483 aa  44.3  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  26.42 
 
 		 356 aa  43.9  0.008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>