19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0536 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  75.37 
 
 		 657 aa  970    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  100 
 
 		 631 aa  1314    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  64.74 
 
 		 618 aa  812    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  64.4 
 
 		 626 aa  802    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  57.5 
 
 		 620 aa  734    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  62.79 
 
 		 620 aa  819    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  28.55 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.68 
 
 		 790 aa  181  4.999999999999999e-44  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  27.41 
 
 		 709 aa  172  2e-41  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  22.63 
 
 		 949 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  26.58 
 
 		 1532 aa  60.1  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  22.79 
 
 		 1432 aa  58.5  0.0000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  20.71 
 
 		 1344 aa  56.6  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  26.53 
 
 		 412 aa  53.9  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  24.5 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  27.74 
 
 		 418 aa  50.4  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 414 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  30.93 
 
 		 469 aa  45.8  0.002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  29.17 
 
 		 417 aa  44.3  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>