22 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2935 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  100 
 
 		 657 aa  1361    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  65.09 
 
 		 618 aa  815    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  64.59 
 
 		 626 aa  810    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  76.61 
 
 		 631 aa  951    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  58.46 
 
 		 620 aa  738    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  63.91 
 
 		 620 aa  821    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  26.75 
 
 		 620 aa  242  1e-62  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  26.26 
 
 		 790 aa  195  3e-48  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  27.95 
 
 		 709 aa  182  2e-44  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  23.08 
 
 		 949 aa  70.9  0.00000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  23.73 
 
 		 1432 aa  58.9  0.0000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  21.35 
 
 		 1344 aa  55.1  0.000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  25.54 
 
 		 1532 aa  53.5  0.00001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  25.81 
 
 		 412 aa  52.8  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0170  cytochrome c family protein  23.11 
 
 		 596 aa  51.6  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3137  cytochrome c family protein  24.89 
 
 		 591 aa  48.9  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.216201  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  22.91 
 
 		 454 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  26.4 
 
 		 414 aa  45.8  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  27.97 
 
 		 417 aa  45.8  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  23.48 
 
 		 418 aa  44.3  0.007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  20.82 
 
 		 356 aa  44.3  0.007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  25 
 
 		 418 aa  43.9  0.009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>