18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_0537 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  100 
 
 		 414 aa  850    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  72.66 
 
 		 417 aa  634  1e-180  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  57.87 
 
 		 412 aa  520  1e-146  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  59.81 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  60.05 
 
 		 418 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1198  hypothetical protein  52.63 
 
 		 418 aa  440  9.999999999999999e-123  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  27.03 
 
 		 620 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  25.45 
 
 		 790 aa  63.5  0.000000007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  26.56 
 
 		 620 aa  52  0.00002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0170  cytochrome c family protein  29.94 
 
 		 596 aa  51.6  0.00003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  24.8 
 
 		 626 aa  51.2  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  23.68 
 
 		 618 aa  48.9  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.48 
 
 		 712 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.77 
 
 		 806 aa  47  0.0006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  26.4 
 
 		 657 aa  45.8  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  26.43 
 
 		 620 aa  45.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  25.76 
 
 		 625 aa  43.5  0.006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>