20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_4117 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  100 
 
 		 418 aa  870    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  95.45 
 
 		 418 aa  837    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  69.66 
 
 		 412 aa  617  1e-175  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  59.81 
 
 		 414 aa  516  1.0000000000000001e-145  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  56.46 
 
 		 417 aa  496  1e-139  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1198  hypothetical protein  56.17 
 
 		 418 aa  476  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  23.4 
 
 		 620 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.73 
 
 		 790 aa  63.2  0.000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  26.27 
 
 		 623 aa  58.5  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  27.14 
 
 		 623 aa  56.6  0.0000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  24.32 
 
 		 626 aa  53.9  0.000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  28.67 
 
 		 620 aa  53.9  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  26.81 
 
 		 618 aa  53.1  0.000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  25.13 
 
 		 625 aa  53.1  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  24.81 
 
 		 620 aa  50.4  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  27.74 
 
 		 631 aa  50.1  0.00008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0170  cytochrome c family protein  28.07 
 
 		 596 aa  49.7  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  22.15 
 
 		 356 aa  47.4  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  23.08 
 
 		 806 aa  47  0.0007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  23.48 
 
 		 657 aa  44.3  0.004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>