16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Saro_2374 on replicon NC_007794
Organism: Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  100 
 
 		 1532 aa  3209    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  66.25 
 
 		 1432 aa  1387    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  59.99 
 
 		 1344 aa  1775    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  24.37 
 
 		 790 aa  77.8  0.000000000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  30.65 
 
 		 949 aa  73.6  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  22.08 
 
 		 620 aa  67  0.000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  26.58 
 
 		 631 aa  60.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3399  hypothetical protein  33.33 
 
 		 2096 aa  58.5  0.0000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.664853  normal  0.744074 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  25.54 
 
 		 657 aa  53.9  0.00002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  47.17 
 
 		 620 aa  53.9  0.00003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  24.89 
 
 		 618 aa  52  0.00008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  25.32 
 
 		 626 aa  51.2  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  23.46 
 
 		 709 aa  48.5  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3065  PA14 domain-containing protein  29.69 
 
 		 14944 aa  48.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0284  LVIVD repeat-containing protein  26.56 
 
 		 882 aa  47.8  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.635237  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  41.67 
 
 		 620 aa  47.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>