24 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0455 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  76.86 
 
 		 618 aa  981    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  63.33 
 
 		 657 aa  825    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  63.62 
 
 		 631 aa  812    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  77.2 
 
 		 626 aa  986    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1199  hypothetical protein  59.33 
 
 		 620 aa  777    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  100 
 
 		 620 aa  1301    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4024  hypothetical protein  27.3 
 
 		 620 aa  218  2e-55  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0197214  unclonable  0.000000000330644 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  26.03 
 
 		 790 aa  188  2e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1461  hypothetical protein  27.11 
 
 		 709 aa  162  1e-38  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.642197  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1870  hypothetical protein  21.59 
 
 		 949 aa  72  0.00000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  decreased coverage  0.00747265  normal  0.613683 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0223  LVIVD repeat-containing protein  23.26 
 
 		 1344 aa  65.5  0.000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2767  LVIVD  24.77 
 
 		 1432 aa  64.3  0.000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.494002  normal  0.413378 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0456  hypothetical protein  24.83 
 
 		 412 aa  58.9  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2374  multihaem cytochrome  47.17 
 
 		 1532 aa  53.9  0.000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4026  hypothetical protein  28.06 
 
 		 418 aa  53.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4117  hypothetical protein  28.67 
 
 		 418 aa  53.5  0.00001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.596924 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0537  cytochrome c family protein  26.56 
 
 		 414 aa  52  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.896583  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  23.53 
 
 		 488 aa  51.2  0.00006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.5 
 
 		 454 aa  48.5  0.0003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 483 aa  48.1  0.0005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  29.58 
 
 		 417 aa  47.4  0.0009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.11 
 
 		 456 aa  46.2  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.32 
 
 		 458 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1504  hypothetical protein  47.62 
 
 		 356 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00430527 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>