61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1177 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  69.39 
 
 		 485 aa  698    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  100 
 
 		 483 aa  1012    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  76.65 
 
 		 488 aa  778    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  56.78 
 
 		 482 aa  573  1.0000000000000001e-162  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  44.96 
 
 		 471 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  44.26 
 
 		 468 aa  383  1e-105  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  43.61 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  43.79 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  43.82 
 
 		 462 aa  368  1e-100  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  43.79 
 
 		 462 aa  367  1e-100  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  43.61 
 
 		 462 aa  366  1e-100  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  43.81 
 
 		 464 aa  365  1e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  43.58 
 
 		 462 aa  365  1e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  43.64 
 
 		 464 aa  363  4e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  43.19 
 
 		 461 aa  363  5.0000000000000005e-99  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  39.8 
 
 		 474 aa  362  7.0000000000000005e-99  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  43.29 
 
 		 474 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  43.7 
 
 		 467 aa  347  2e-94  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  39.74 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  37.28 
 
 		 542 aa  294  2e-78  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  37.9 
 
 		 564 aa  292  1e-77  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  34.79 
 
 		 551 aa  291  1e-77  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  36.46 
 
 		 524 aa  290  3e-77  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  36.33 
 
 		 539 aa  287  2.9999999999999996e-76  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  37.13 
 
 		 506 aa  287  2.9999999999999996e-76  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  37.55 
 
 		 541 aa  285  9e-76  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  36.08 
 
 		 535 aa  284  3.0000000000000004e-75  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  36.84 
 
 		 535 aa  277  4e-73  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  34.79 
 
 		 535 aa  276  6e-73  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  36.21 
 
 		 535 aa  275  1.0000000000000001e-72  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  36.7 
 
 		 535 aa  272  1e-71  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  37.15 
 
 		 567 aa  265  2e-69  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  36.4 
 
 		 557 aa  263  4.999999999999999e-69  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  38.05 
 
 		 538 aa  257  3e-67  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  36.4 
 
 		 550 aa  253  7e-66  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  32.09 
 
 		 555 aa  247  3e-64  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  31.81 
 
 		 576 aa  229  9e-59  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  30.77 
 
 		 777 aa  174  5e-42  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.33 
 
 		 777 aa  171  3e-41  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  31.86 
 
 		 630 aa  169  9e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  31.86 
 
 		 793 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  31 
 
 		 715 aa  168  2e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  29.82 
 
 		 780 aa  168  2e-40  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  30.09 
 
 		 605 aa  152  1e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  28.31 
 
 		 456 aa  150  3e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.54 
 
 		 469 aa  150  7e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  27.98 
 
 		 454 aa  144  3e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  29.07 
 
 		 458 aa  141  3e-32  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  28.42 
 
 		 587 aa  141  3e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  27.97 
 
 		 457 aa  139  7.999999999999999e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  29.63 
 
 		 463 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  27.07 
 
 		 459 aa  132  9e-30  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  29.32 
 
 		 461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 459 aa  132  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  26.62 
 
 		 565 aa  131  3e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  27.91 
 
 		 459 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.67 
 
 		 604 aa  102  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  28.4 
 
 		 620 aa  47.8  0.0005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  33.77 
 
 		 626 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.41 
 
 		 696 aa  45.4  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4118  hypothetical protein  35.06 
 
 		 618 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.41011 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>