58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1392 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  60.8 
 
 		 567 aa  673    Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  100 
 
 		 541 aa  1139    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  62.43 
 
 		 550 aa  692    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  60.7 
 
 		 542 aa  628  1e-179  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  58.28 
 
 		 564 aa  608  1e-173  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  55.49 
 
 		 557 aa  593  1e-168  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  51.2 
 
 		 535 aa  507  9.999999999999999e-143  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  51 
 
 		 535 aa  505  9.999999999999999e-143  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  50.4 
 
 		 524 aa  493  9.999999999999999e-139  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  50.9 
 
 		 535 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 535 aa  487  1e-136  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  49.9 
 
 		 535 aa  482  1e-135  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  46.31 
 
 		 506 aa  452  1e-125  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  50.9 
 
 		 462 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  50.68 
 
 		 462 aa  444  1e-123  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  50.23 
 
 		 462 aa  439  9.999999999999999e-123  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  49.77 
 
 		 461 aa  438  1e-121  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  41.93 
 
 		 555 aa  430  1e-119  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  49.1 
 
 		 464 aa  426  1e-118  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  48.42 
 
 		 462 aa  424  1e-117  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  48.2 
 
 		 462 aa  423  1e-117  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  48.42 
 
 		 462 aa  425  1e-117  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  48.44 
 
 		 471 aa  422  1e-117  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  48.63 
 
 		 468 aa  419  1e-116  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  45.19 
 
 		 539 aa  422  1e-116  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  47.63 
 
 		 474 aa  421  1e-116  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  47.05 
 
 		 474 aa  414  1e-114  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  44.33 
 
 		 551 aa  414  1e-114  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  46.98 
 
 		 538 aa  411  1e-113  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  47.6 
 
 		 464 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  48.18 
 
 		 467 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  42.35 
 
 		 467 aa  347  4e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  41.56 
 
 		 482 aa  342  1e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  40.38 
 
 		 485 aa  325  1e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  38.89 
 
 		 488 aa  295  2e-78  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  37.55 
 
 		 483 aa  285  2.0000000000000002e-75  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  32.59 
 
 		 576 aa  226  7e-58  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  34.16 
 
 		 777 aa  206  1e-51  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  34.16 
 
 		 777 aa  205  2e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  33.26 
 
 		 780 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  29.58 
 
 		 793 aa  183  8.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  30 
 
 		 630 aa  182  1e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  30.8 
 
 		 605 aa  171  4e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.73 
 
 		 715 aa  170  7e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.84 
 
 		 565 aa  159  2e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  28.74 
 
 		 604 aa  154  5e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.4 
 
 		 587 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.86 
 
 		 469 aa  139  2e-31  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 458 aa  126  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  28.08 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 459 aa  108  2e-22  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  26.11 
 
 		 459 aa  106  8e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  26.35 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  26.12 
 
 		 461 aa  100  9e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  26.75 
 
 		 463 aa  99.4  1e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 454 aa  98.2  3e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  25.26 
 
 		 457 aa  96.3  1e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  25.28 
 
 		 712 aa  45.1  0.003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>