64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0972 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  96.73 
 
 
459 aa  913    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  69.07 
 
 
458 aa  650    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  70.72 
 
 
456 aa  703    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  73.63 
 
 
454 aa  713    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  100 
 
 
459 aa  961    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  75.38 
 
 
463 aa  743    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  74.03 
 
 
457 aa  735    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  96.51 
 
 
459 aa  912    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  75.54 
 
 
461 aa  733    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  31.48 
 
 
469 aa  188  1e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  30.14 
 
 
474 aa  163  6e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  29.94 
 
 
464 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  28.78 
 
 
474 aa  145  1e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  28.87 
 
 
482 aa  139  1e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  28.25 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  28.29 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  28.25 
 
 
462 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  28.21 
 
 
462 aa  136  9.999999999999999e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  28.01 
 
 
462 aa  134  3e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  28.01 
 
 
462 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  27.91 
 
 
483 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  27.88 
 
 
461 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  28.8 
 
 
471 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  28.01 
 
 
488 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  28.73 
 
 
464 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  24.68 
 
 
715 aa  128  2.0000000000000002e-28  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  24.89 
 
 
793 aa  124  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  24.24 
 
 
630 aa  125  2e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  26.9 
 
 
468 aa  123  6e-27  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  26.94 
 
 
485 aa  123  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.05 
 
 
535 aa  123  7e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  28.57 
 
 
551 aa  123  8e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  29.55 
 
 
467 aa  119  9.999999999999999e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  28.57 
 
 
467 aa  118  3e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  25.26 
 
 
524 aa  117  3.9999999999999997e-25  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  26.28 
 
 
539 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  25.62 
 
 
535 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  23.66 
 
 
565 aa  115  2.0000000000000002e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  28.24 
 
 
538 aa  114  4.0000000000000004e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  25.22 
 
 
605 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  27.18 
 
 
550 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  26.95 
 
 
557 aa  108  1e-22  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  26.37 
 
 
541 aa  107  5e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  26.39 
 
 
567 aa  105  1e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  26.04 
 
 
576 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  25.46 
 
 
555 aa  105  2e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  26.75 
 
 
542 aa  102  1e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  24.48 
 
 
506 aa  102  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  25.57 
 
 
535 aa  99  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  24.63 
 
 
535 aa  95.9  1e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  24.64 
 
 
604 aa  92.4  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  25.37 
 
 
564 aa  92  2e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  24.9 
 
 
535 aa  87.4  5e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  23.33 
 
 
587 aa  82.8  0.00000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.32 
 
 
696 aa  60.8  0.00000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25.87 
 
 
777 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  25.99 
 
 
780 aa  57.4  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  25.56 
 
 
777 aa  55.5  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  24.59 
 
 
623 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  24.59 
 
 
623 aa  50.8  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  25.52 
 
 
625 aa  49.7  0.0001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0348  cytochrome c, putative  22.65 
 
 
679 aa  43.9  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  21.18 
 
 
676 aa  43.5  0.007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1385  hypothetical protein  23.61 
 
 
490 aa  43.5  0.009  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>