66 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gmet_3088 on replicon NC_007517
Organism: Geobacter metallireducens GS-15



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  77.83 
 
 		 456 aa  766    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  100 
 
 		 454 aa  953    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  73.93 
 
 		 459 aa  702    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  69.13 
 
 		 463 aa  683    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  73.07 
 
 		 459 aa  706    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  74.12 
 
 		 457 aa  731    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  69.43 
 
 		 461 aa  678    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  73.07 
 
 		 459 aa  706    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  66.59 
 
 		 458 aa  627  1e-178  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  31.66 
 
 		 469 aa  177  3e-43  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  30.15 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  30.29 
 
 		 464 aa  148  2.0000000000000003e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  27.36 
 
 		 488 aa  144  2e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  27.79 
 
 		 483 aa  139  7e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  27.81 
 
 		 474 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  27.44 
 
 		 482 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  28.34 
 
 		 471 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  26.8 
 
 		 461 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  26.6 
 
 		 462 aa  132  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  26.6 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  26.6 
 
 		 462 aa  131  2.0000000000000002e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  27.07 
 
 		 462 aa  130  3e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  27.14 
 
 		 468 aa  130  5.0000000000000004e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  26.87 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  27.27 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  25.81 
 
 		 485 aa  126  8.000000000000001e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  26.46 
 
 		 565 aa  125  1e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  27.92 
 
 		 464 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  28.82 
 
 		 467 aa  123  7e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  25.53 
 
 		 551 aa  119  9.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  28.69 
 
 		 535 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.6 
 
 		 605 aa  118  1.9999999999999998e-25  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  26.96 
 
 		 467 aa  117  5e-25  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  24.78 
 
 		 630 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  24.78 
 
 		 793 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  26.98 
 
 		 557 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  24.35 
 
 		 715 aa  114  3e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  26.23 
 
 		 550 aa  114  5e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  25.15 
 
 		 524 aa  108  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 542 aa  108  2e-22  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  26.52 
 
 		 539 aa  107  4e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 535 aa  106  7e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  26.12 
 
 		 567 aa  104  4e-21  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  24.22 
 
 		 506 aa  102  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  26.69 
 
 		 538 aa  99  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 541 aa  98.2  2e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  24.9 
 
 		 576 aa  97.4  5e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  25.9 
 
 		 564 aa  94.4  3e-18  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 535 aa  93.6  7e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  23.3 
 
 		 555 aa  91.7  2e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  25.77 
 
 		 604 aa  87.4  4e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  25.21 
 
 		 535 aa  85.5  0.000000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  23.34 
 
 		 587 aa  84.7  0.000000000000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25 
 
 		 777 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  25 
 
 		 777 aa  59.3  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  24.92 
 
 		 780 aa  59.7  0.0000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.65 
 
 		 696 aa  55.5  0.000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  26.41 
 
 		 623 aa  52.8  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  25.64 
 
 		 623 aa  51.2  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  27.85 
 
 		 625 aa  50.8  0.00005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0455  hypothetical protein  24.5 
 
 		 620 aa  48.5  0.0003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2934  cytochrome c family protein  26.09 
 
 		 417 aa  47.8  0.0005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4027  hypothetical protein  23.46 
 
 		 626 aa  46.2  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  22.91 
 
 		 657 aa  46.6  0.001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4456  cytochrome c, putative  23.15 
 
 		 676 aa  44.7  0.004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>