85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_1724 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  100 
 
 		 604 aa  1244    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  53 
 
 		 793 aa  589  1e-167  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  50.74 
 
 		 715 aa  560  1e-158  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  50.4 
 
 		 630 aa  473  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  53.33 
 
 		 605 aa  466  9.999999999999999e-131  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  49.71 
 
 		 565 aa  420  1e-116  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  39.53 
 
 		 587 aa  342  9e-93  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  30.85 
 
 		 471 aa  163  8.000000000000001e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  29.08 
 
 		 541 aa  162  2e-38  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  29.22 
 
 		 464 aa  158  2e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  29.77 
 
 		 462 aa  157  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  29.77 
 
 		 462 aa  157  6e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  30.05 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  29.59 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  30.05 
 
 		 462 aa  155  2e-36  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  29.77 
 
 		 462 aa  155  2.9999999999999998e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  30.09 
 
 		 468 aa  153  1e-35  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  28.86 
 
 		 461 aa  150  7e-35  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  29.69 
 
 		 542 aa  147  6e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  28.25 
 
 		 464 aa  147  8.000000000000001e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  28.14 
 
 		 469 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  28.27 
 
 		 485 aa  145  2e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.2 
 
 		 557 aa  144  4e-33  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 567 aa  142  1.9999999999999998e-32  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  28.83 
 
 		 467 aa  142  1.9999999999999998e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  28.76 
 
 		 564 aa  141  3e-32  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  26.55 
 
 		 524 aa  139  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  26.33 
 
 		 506 aa  137  7.000000000000001e-31  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  26.91 
 
 		 482 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  26.56 
 
 		 474 aa  135  3e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.05 
 
 		 535 aa  134  3e-30  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  26.39 
 
 		 535 aa  134  6.999999999999999e-30  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  27.44 
 
 		 474 aa  131  4.0000000000000003e-29  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  25.6 
 
 		 535 aa  128  2.0000000000000002e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  28.35 
 
 		 550 aa  125  2e-27  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  26.04 
 
 		 535 aa  125  2e-27  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  26.23 
 
 		 551 aa  124  4e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  27.25 
 
 		 467 aa  124  6e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  26.64 
 
 		 488 aa  123  9e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  28.13 
 
 		 576 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.06 
 
 		 535 aa  119  1.9999999999999998e-25  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  25.96 
 
 		 555 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  24.59 
 
 		 780 aa  111  3e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  26.85 
 
 		 483 aa  109  1e-22  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  24.78 
 
 		 539 aa  107  7e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  24.36 
 
 		 777 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  24.13 
 
 		 777 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  26.95 
 
 		 538 aa  105  3e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  25.99 
 
 		 461 aa  103  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  25.37 
 
 		 457 aa  102  2e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  25.34 
 
 		 456 aa  101  3e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  25.26 
 
 		 463 aa  100  9e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  25.69 
 
 		 458 aa  99  3e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25 
 
 		 459 aa  95.5  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  25.17 
 
 		 459 aa  94.7  4e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  25 
 
 		 459 aa  94.7  5e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25.17 
 
 		 454 aa  91.3  4e-17  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  54.44 
 
 		 1657 aa  86.3  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  51.09 
 
 		 1825 aa  85.5  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  40 
 
 		 1951 aa  70.5  0.00000000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  39 
 
 		 2117 aa  67.4  0.0000000007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  29.77 
 
 		 637 aa  65.5  0.000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  38.46 
 
 		 635 aa  56.6  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  38.75 
 
 		 878 aa  55.5  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  37.5 
 
 		 878 aa  53.9  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  36.54 
 
 		 1026 aa  51.6  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.06 
 
 		 940 aa  50.4  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  33.05 
 
 		 1467 aa  48.9  0.0003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  37.33 
 
 		 652 aa  48.9  0.0003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  35.96 
 
 		 639 aa  48.5  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1484  hypothetical protein  39.19 
 
 		 1128 aa  48.1  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.848457  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  31.15 
 
 		 759 aa  47.8  0.0007  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3358  hypothetical protein  41.18 
 
 		 743 aa  47  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.0199152 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3093  PA14 domain protein  30.77 
 
 		 569 aa  46.6  0.001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  38.89 
 
 		 551 aa  46.6  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  35.96 
 
 		 1641 aa  45.4  0.003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.45 
 
 		 788 aa  45.1  0.004  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0829  endonuclease/exonuclease/phosphatase  31.37 
 
 		 790 aa  45.1  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.889432  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0063  Beta-N-acetylhexosaminidase  33.33 
 
 		 779 aa  45.1  0.004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0268197  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  28.43 
 
 		 788 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.41 
 
 		 788 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0165  WD-40 repeat-containing protein  38.46 
 
 		 848 aa  43.9  0.009  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.748884  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  26.53 
 
 		 878 aa  43.9  0.009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  27.45 
 
 		 788 aa  43.9  0.009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  28.43 
 
 		 788 aa  43.5  0.01  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>