63 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gura_0672 on replicon NC_009483
Organism: Geobacter uraniireducens Rf4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  100 
 
 		 469 aa  981    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  31.4 
 
 		 459 aa  186  8e-46  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  30.97 
 
 		 459 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  32.18 
 
 		 457 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  32.46 
 
 		 459 aa  180  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  29.83 
 
 		 456 aa  179  7e-44  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  29.08 
 
 		 793 aa  179  1e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  31.66 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  30.13 
 
 		 630 aa  176  7e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  31.74 
 
 		 458 aa  174  2.9999999999999996e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  29.12 
 
 		 715 aa  172  9e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  31.1 
 
 		 605 aa  170  5e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  29.21 
 
 		 565 aa  169  9e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  30.82 
 
 		 482 aa  167  4e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  29.45 
 
 		 468 aa  161  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  29.89 
 
 		 463 aa  160  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  28.85 
 
 		 462 aa  160  6e-38  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  28.63 
 
 		 462 aa  159  8e-38  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  29.96 
 
 		 474 aa  158  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  28.41 
 
 		 462 aa  158  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  31.35 
 
 		 464 aa  157  4e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  28.63 
 
 		 461 aa  155  1e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  30.02 
 
 		 474 aa  155  1e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  28.26 
 
 		 485 aa  155  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  29.38 
 
 		 461 aa  154  2.9999999999999998e-36  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  29.16 
 
 		 535 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  29.21 
 
 		 471 aa  153  5e-36  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  27.83 
 
 		 488 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  27.75 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  28.66 
 
 		 464 aa  152  1e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  27.75 
 
 		 462 aa  152  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  27.75 
 
 		 462 aa  152  2e-35  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  30.02 
 
 		 467 aa  150  5e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  28.54 
 
 		 564 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  29.38 
 
 		 542 aa  148  2.0000000000000003e-34  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  28.2 
 
 		 483 aa  147  4.0000000000000006e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  28.33 
 
 		 524 aa  145  2e-33  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  27.79 
 
 		 506 aa  143  6e-33  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.07 
 
 		 587 aa  143  6e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  27.72 
 
 		 550 aa  140  6e-32  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  28.14 
 
 		 604 aa  139  1e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 541 aa  139  1e-31  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.9 
 
 		 557 aa  137  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  27.33 
 
 		 551 aa  132  2.0000000000000002e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.29 
 
 		 535 aa  130  3e-29  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  28.78 
 
 		 567 aa  131  3e-29  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  27.49 
 
 		 535 aa  130  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  27.25 
 
 		 467 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  27.11 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  27.09 
 
 		 535 aa  129  1.0000000000000001e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  26.29 
 
 		 555 aa  124  4e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 538 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  25.85 
 
 		 539 aa  116  6.9999999999999995e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  24.1 
 
 		 576 aa  102  1e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  24.09 
 
 		 780 aa  77.4  0.0000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25.7 
 
 		 777 aa  75.9  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  23.53 
 
 		 777 aa  75.1  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.9 
 
 		 696 aa  60.1  0.00000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0536  cytochrome c family protein  32.32 
 
 		 631 aa  46.2  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0814025  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1807  hypothetical protein  23.2 
 
 		 790 aa  46.6  0.001  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2935  cytochrome c family protein  30.93 
 
 		 657 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3626  cytochrome C family protein  25.24 
 
 		 299 aa  43.5  0.008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0432  putative lipoprotein  25.84 
 
 		 268 aa  43.5  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>