60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_4144 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  100 
 
 		 461 aa  969    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  90.02 
 
 		 462 aa  895    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  80.86 
 
 		 467 aa  767    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  90.02 
 
 		 462 aa  895    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  90.02 
 
 		 462 aa  895    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  77.61 
 
 		 468 aa  781    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  96.1 
 
 		 462 aa  935    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  96.1 
 
 		 462 aa  935    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  80.59 
 
 		 464 aa  773    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  75.7 
 
 		 471 aa  765    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  97.18 
 
 		 462 aa  947    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  53.81 
 
 		 464 aa  483  1e-135  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  50.96 
 
 		 474 aa  459  9.999999999999999e-129  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  47.17 
 
 		 474 aa  446  1.0000000000000001e-124  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  49.77 
 
 		 541 aa  438  9.999999999999999e-123  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  46.79 
 
 		 482 aa  418  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  48.1 
 
 		 524 aa  407  1.0000000000000001e-112  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  47.66 
 
 		 535 aa  402  1e-111  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  45.32 
 
 		 485 aa  403  1e-111  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  46.5 
 
 		 542 aa  397  1e-109  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  46.77 
 
 		 535 aa  394  1e-108  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  46.55 
 
 		 535 aa  391  1e-107  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  47.3 
 
 		 567 aa  392  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  45.54 
 
 		 535 aa  387  1e-106  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  44.92 
 
 		 550 aa  387  1e-106  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  44.69 
 
 		 506 aa  382  1e-105  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  47.15 
 
 		 467 aa  375  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  46.86 
 
 		 557 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  44.94 
 
 		 564 aa  378  1e-103  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  45.43 
 
 		 535 aa  370  1e-101  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  42.09 
 
 		 555 aa  370  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  42.65 
 
 		 488 aa  367  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  43.44 
 
 		 483 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  42.67 
 
 		 539 aa  350  2e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  42.86 
 
 		 551 aa  351  2e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  43.94 
 
 		 538 aa  342  5.999999999999999e-93  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  36.45 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  33.73 
 
 		 777 aa  220  5e-56  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  33.73 
 
 		 777 aa  219  6e-56  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  35.02 
 
 		 780 aa  217  2.9999999999999998e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  32.08 
 
 		 793 aa  193  6e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  32.73 
 
 		 630 aa  193  7e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  31.57 
 
 		 715 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.77 
 
 		 587 aa  177  4e-43  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  30.68 
 
 		 605 aa  169  1e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  28.09 
 
 		 565 aa  162  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  28.63 
 
 		 469 aa  155  1e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  29.01 
 
 		 604 aa  144  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.45 
 
 		 456 aa  143  7e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  26.8 
 
 		 454 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  28.05 
 
 		 458 aa  130  5.0000000000000004e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  28.8 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 459 aa  126  6e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  27.84 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  27.66 
 
 		 459 aa  124  5e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  29.14 
 
 		 461 aa  123  6e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  27.23 
 
 		 457 aa  115  1.0000000000000001e-24  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1385  hypothetical protein  22.17 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  23.29 
 
 		 696 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0432  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 268 aa  43.1  0.009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>