59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cpha266_2104 on replicon NC_008639
Organism: Chlorobium phaeobacteroides DSM 266



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  71.54 
 
 		 535 aa  803    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  95.69 
 
 		 535 aa  1030    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  100 
 
 		 535 aa  1120    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  70.36 
 
 		 535 aa  814    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  73.05 
 
 		 535 aa  813    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  73.17 
 
 		 524 aa  814    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  50.3 
 
 		 506 aa  512  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  48.61 
 
 		 551 aa  509  1e-143  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  50.6 
 
 		 557 aa  503  1e-141  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  49.9 
 
 		 541 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  49.59 
 
 		 542 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  49.61 
 
 		 567 aa  485  1e-136  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  45.94 
 
 		 555 aa  487  1e-136  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  50.31 
 
 		 550 aa  483  1e-135  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  45.4 
 
 		 539 aa  472  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 538 aa  471  1.0000000000000001e-131  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  47.34 
 
 		 564 aa  466  9.999999999999999e-131  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  47.44 
 
 		 462 aa  406  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  47.95 
 
 		 474 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  47.44 
 
 		 462 aa  407  1.0000000000000001e-112  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  45.96 
 
 		 464 aa  405  1e-111  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  46.99 
 
 		 461 aa  403  1e-111  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  47.22 
 
 		 462 aa  403  1e-111  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  45.51 
 
 		 468 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  46.44 
 
 		 462 aa  401  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  44.33 
 
 		 462 aa  399  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  44.53 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  48.06 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  45.81 
 
 		 474 aa  391  1e-107  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  44.35 
 
 		 471 aa  379  1e-104  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  44.32 
 
 		 467 aa  374  1e-102  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  39.61 
 
 		 482 aa  334  2e-90  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  41.14 
 
 		 467 aa  322  9.999999999999999e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  38.03 
 
 		 485 aa  306  6e-82  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  37.93 
 
 		 488 aa  281  3e-74  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  36.63 
 
 		 483 aa  278  1e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  34.42 
 
 		 576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.34 
 
 		 777 aa  176  7e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  30.34 
 
 		 777 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.11 
 
 		 780 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  28.79 
 
 		 715 aa  163  8.000000000000001e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  28.54 
 
 		 793 aa  162  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  28.54 
 
 		 630 aa  161  3e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  30.59 
 
 		 587 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.52 
 
 		 605 aa  143  7e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  27.09 
 
 		 469 aa  142  1.9999999999999998e-32  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  25.81 
 
 		 565 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.35 
 
 		 458 aa  128  3e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.79 
 
 		 456 aa  121  3.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  25.84 
 
 		 604 aa  120  6e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  27.65 
 
 		 461 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  26.39 
 
 		 463 aa  114  3e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  25.69 
 
 		 457 aa  111  3e-23  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  26.03 
 
 		 459 aa  110  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  25.83 
 
 		 459 aa  108  3e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  25.36 
 
 		 459 aa  106  1e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  25.58 
 
 		 454 aa  102  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  29.25 
 
 		 696 aa  46.2  0.002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  22.02 
 
 		 664 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>