86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Glov_1467 on replicon NC_010814
Organism: Geobacter lovleyi SZ



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  87.27 
 
 		 630 aa  920    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  82.49 
 
 		 793 aa  1033    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  100 
 
 		 715 aa  1471    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  51.24 
 
 		 604 aa  556  1e-157  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  49.7 
 
 		 605 aa  454  1.0000000000000001e-126  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  45.49 
 
 		 565 aa  422  1e-117  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  38.43 
 
 		 587 aa  338  2.9999999999999997e-91  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  31.05 
 
 		 482 aa  187  8e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  31.57 
 
 		 461 aa  185  3e-45  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  30.3 
 
 		 462 aa  183  9.000000000000001e-45  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  30.91 
 
 		 462 aa  182  2e-44  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  31.78 
 
 		 462 aa  181  4e-44  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  30.09 
 
 		 462 aa  181  4e-44  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  32 
 
 		 462 aa  181  4.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  31.15 
 
 		 462 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  31.74 
 
 		 488 aa  177  8e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  31.11 
 
 		 542 aa  176  9e-43  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  29.27 
 
 		 468 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  30.58 
 
 		 471 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.53 
 
 		 469 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  29.54 
 
 		 464 aa  175  2.9999999999999996e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  28.79 
 
 		 474 aa  172  1e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  31.44 
 
 		 483 aa  172  2e-41  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  28.73 
 
 		 541 aa  171  3e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  28.48 
 
 		 464 aa  168  2.9999999999999998e-40  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  28.92 
 
 		 524 aa  166  1.0000000000000001e-39  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  29.8 
 
 		 485 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  28.36 
 
 		 474 aa  165  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  29.1 
 
 		 567 aa  162  2e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  28.63 
 
 		 535 aa  159  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  28.79 
 
 		 535 aa  159  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  28.38 
 
 		 506 aa  157  8e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  28.92 
 
 		 535 aa  156  2e-36  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  27.71 
 
 		 576 aa  154  7e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  26.83 
 
 		 564 aa  154  8e-36  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  28.1 
 
 		 557 aa  150  6e-35  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  29.32 
 
 		 467 aa  150  6e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 535 aa  150  7e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  28.19 
 
 		 551 aa  150  9e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  28.79 
 
 		 467 aa  147  5e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  27.76 
 
 		 550 aa  147  8.000000000000001e-34  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.43 
 
 		 535 aa  143  9.999999999999999e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  26.67 
 
 		 539 aa  135  1.9999999999999998e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.75 
 
 		 457 aa  135  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  25.37 
 
 		 555 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  25.16 
 
 		 456 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  25.11 
 
 		 459 aa  131  4.0000000000000003e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  25 
 
 		 459 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.68 
 
 		 459 aa  127  5e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  24.79 
 
 		 461 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  25.35 
 
 		 463 aa  124  5e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  27.58 
 
 		 538 aa  124  9e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  24.73 
 
 		 458 aa  122  3e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.78 
 
 		 454 aa  117  1.0000000000000001e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  25.41 
 
 		 780 aa  115  4.0000000000000004e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  24.94 
 
 		 777 aa  111  4.0000000000000004e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  25.17 
 
 		 777 aa  111  5e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3016  hypothetical protein  60.24 
 
 		 1825 aa  84.7  0.000000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1160  hypothetical protein  48.28 
 
 		 1657 aa  73.6  0.00000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0070  APHP domain-containing protein  43.9 
 
 		 1951 aa  72.4  0.00000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3167  S-layer domain-containing protein  36.64 
 
 		 637 aa  72  0.00000000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0044  hypothetical protein  38 
 
 		 2117 aa  58.9  0.0000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1799  glycoside hydrolase family protein  40.34 
 
 		 551 aa  57.4  0.0000009  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000760023  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4198  alpha amylase catalytic region  34.83 
 
 		 878 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6648  coagulation factor 5/8 type domain protein  46.58 
 
 		 940 aa  55.8  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0314852  normal  0.100583 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1076  Ig-like domain-containing protein  46.97 
 
 		 1937 aa  54.3  0.000007  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.659713  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4158  alpha amylase catalytic region  33.71 
 
 		 878 aa  54.3  0.000008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1800  glycoside hydrolase family protein  37.93 
 
 		 652 aa  52.8  0.00002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0348048  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0334  hypothetical protein  35.23 
 
 		 1026 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0760219  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6649  coagulation factor 5/8 type domain protein  43.04 
 
 		 639 aa  52.4  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.193919  normal  0.238466 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1078  Ig-like domain-containing protein  36.67 
 
 		 1467 aa  52.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2865  Fibronectin type III domain protein  36.96 
 
 		 759 aa  51.6  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.59 
 
 		 696 aa  50.1  0.0001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0148  alpha amylase catalytic region  30.95 
 
 		 878 aa  49.3  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0174055 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0988  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 788 aa  48.5  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1234  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  41.67 
 
 		 788 aa  48.1  0.0005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0992  endonuclease/exonuclease/phosphatase  40.28 
 
 		 788 aa  48.1  0.0006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.511049  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0346  hypothetical protein  32.95 
 
 		 635 aa  47.8  0.0006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1156  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  41.67 
 
 		 788 aa  47.8  0.0007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0990  endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.67 
 
 		 788 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.442122  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4198  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.28 
 
 		 788 aa  47.8  0.0008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1107  endonuclease/exonuclease/phosphatase family  40.28 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1171  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  38.89 
 
 		 788 aa  47.4  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0436  S-layer domain protein  45.61 
 
 		 1226 aa  45.8  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000313752 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1003  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  40.28 
 
 		 788 aa  46.6  0.002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0487379  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1101  Spore coat protein CotH  40.54 
 
 		 621 aa  44.3  0.007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>