59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GSU2299 on replicon NC_002939
Organism: Geobacter sulfurreducens PCA



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  100 
 
 		 482 aa  1006    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  59.34 
 
 		 485 aa  612  9.999999999999999e-175  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  58.09 
 
 		 488 aa  581  1.0000000000000001e-165  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  58.7 
 
 		 483 aa  569  1e-161  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  46.58 
 
 		 468 aa  431  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  48.57 
 
 		 464 aa  422  1e-117  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  46.56 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  46.83 
 
 		 464 aa  421  1e-116  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  46.86 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  46.76 
 
 		 462 aa  420  1e-116  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  46.86 
 
 		 462 aa  419  1e-116  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  46.79 
 
 		 461 aa  418  9.999999999999999e-116  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  46.65 
 
 		 462 aa  416  9.999999999999999e-116  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  47.16 
 
 		 471 aa  417  9.999999999999999e-116  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  46.03 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  45.25 
 
 		 474 aa  411  1e-113  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  44.65 
 
 		 474 aa  405  1.0000000000000001e-112  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  44.78 
 
 		 467 aa  385  1e-106  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  42.21 
 
 		 542 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  41.9 
 
 		 564 aa  352  1e-95  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  41.56 
 
 		 541 aa  342  1e-92  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  40.12 
 
 		 467 aa  340  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  41.59 
 
 		 535 aa  335  1e-90  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  41.29 
 
 		 535 aa  332  7.000000000000001e-90  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  40.6 
 
 		 524 aa  330  2e-89  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  41.14 
 
 		 506 aa  328  1.0000000000000001e-88  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  38.97 
 
 		 535 aa  327  2.0000000000000001e-88  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  38.97 
 
 		 535 aa  327  3e-88  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  39.04 
 
 		 567 aa  318  1e-85  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  38.9 
 
 		 551 aa  317  4e-85  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  39.78 
 
 		 535 aa  316  6e-85  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  39.04 
 
 		 557 aa  313  5.999999999999999e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  39.48 
 
 		 550 aa  312  1e-83  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  38.56 
 
 		 539 aa  305  1.0000000000000001e-81  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  37.76 
 
 		 555 aa  295  9e-79  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  39.75 
 
 		 538 aa  289  6e-77  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  31.19 
 
 		 576 aa  232  9e-60  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.32 
 
 		 777 aa  197  4.0000000000000005e-49  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  30.51 
 
 		 777 aa  194  2e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  32.58 
 
 		 793 aa  195  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  32.21 
 
 		 630 aa  194  2e-48  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  30.79 
 
 		 780 aa  194  3e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  33.33 
 
 		 605 aa  189  1e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  30.84 
 
 		 715 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.37 
 
 		 587 aa  169  1e-40  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  30.82 
 
 		 469 aa  167  4e-40  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  28.4 
 
 		 456 aa  154  4e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  30.07 
 
 		 457 aa  152  2e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  29.01 
 
 		 463 aa  146  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.17 
 
 		 565 aa  145  2e-33  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  28.36 
 
 		 459 aa  144  3e-33  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.76 
 
 		 461 aa  139  8.999999999999999e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  30.2 
 
 		 458 aa  139  1e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  27.44 
 
 		 454 aa  135  9.999999999999999e-31  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.67 
 
 		 459 aa  133  6e-30  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.84 
 
 		 604 aa  127  3e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1542  cytochrome C family protein  22.02 
 
 		 655 aa  44.3  0.005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0724057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  24.45 
 
 		 696 aa  43.9  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>