57 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_2184 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  100 
 
 		 587 aa  1216    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  39.13 
 
 		 565 aa  369  1e-101  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  39.34 
 
 		 793 aa  351  2e-95  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  39.22 
 
 		 630 aa  345  2e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  41.57 
 
 		 605 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  39.03 
 
 		 604 aa  334  2e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  38.24 
 
 		 715 aa  330  3e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  30.89 
 
 		 464 aa  179  9e-44  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  30.12 
 
 		 462 aa  178  2e-43  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  30.12 
 
 		 462 aa  179  2e-43  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  29.77 
 
 		 461 aa  177  4e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  29.59 
 
 		 462 aa  176  9.999999999999999e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  29.86 
 
 		 462 aa  175  1.9999999999999998e-42  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  29.92 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  30.27 
 
 		 462 aa  174  2.9999999999999996e-42  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  28.89 
 
 		 468 aa  171  4e-41  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  29.37 
 
 		 482 aa  169  1e-40  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  32.07 
 
 		 542 aa  168  2e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  30.24 
 
 		 464 aa  167  4e-40  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  29 
 
 		 564 aa  167  6.9999999999999995e-40  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  28.79 
 
 		 485 aa  161  4e-38  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  29.39 
 
 		 488 aa  159  2e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  29.89 
 
 		 467 aa  158  3e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  29.08 
 
 		 471 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  29.03 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  27.65 
 
 		 474 aa  155  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  31.14 
 
 		 567 aa  154  4e-36  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  30 
 
 		 524 aa  154  4e-36  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  29.98 
 
 		 535 aa  154  4e-36  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  30.59 
 
 		 535 aa  153  8e-36  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  30.51 
 
 		 535 aa  151  3e-35  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  27.88 
 
 		 541 aa  151  4e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  28.11 
 
 		 551 aa  149  2.0000000000000003e-34  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  29.98 
 
 		 557 aa  147  4.0000000000000006e-34  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  29.23 
 
 		 506 aa  147  5e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.07 
 
 		 469 aa  143  7e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  29.8 
 
 		 535 aa  143  9.999999999999999e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  28.29 
 
 		 539 aa  141  3e-32  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  27.84 
 
 		 483 aa  141  3e-32  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  28.3 
 
 		 535 aa  140  7e-32  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  26.61 
 
 		 576 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  29.28 
 
 		 550 aa  134  3e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  29.57 
 
 		 467 aa  133  9e-30  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  27.22 
 
 		 555 aa  121  4.9999999999999996e-26  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  28.19 
 
 		 538 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  30.7 
 
 		 777 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  26.64 
 
 		 780 aa  110  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  31.23 
 
 		 777 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  26.42 
 
 		 456 aa  100  7e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  26.96 
 
 		 457 aa  92  3e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.03 
 
 		 459 aa  87.8  5e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  23.82 
 
 		 459 aa  85.9  0.000000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  22.91 
 
 		 458 aa  85.5  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  23.33 
 
 		 459 aa  84.7  0.000000000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  23.34 
 
 		 454 aa  84.7  0.000000000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  24.93 
 
 		 463 aa  84  0.000000000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  25.2 
 
 		 461 aa  82.4  0.00000000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>