59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sama_3180 on replicon NC_008700
Organism: Shewanella amazonensis SB2B



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  75.68 
 
 		 467 aa  723    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  75.7 
 
 		 461 aa  765    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  75.87 
 
 		 462 aa  764    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  76.09 
 
 		 462 aa  766    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  78.19 
 
 		 468 aa  772    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  75.87 
 
 		 462 aa  764    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  100 
 
 		 471 aa  985    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  76.57 
 
 		 462 aa  766    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  76.79 
 
 		 462 aa  768    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  74.6 
 
 		 464 aa  718    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  76.57 
 
 		 462 aa  767    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  53.53 
 
 		 464 aa  478  1e-133  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  49.27 
 
 		 474 aa  457  1e-127  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  48.14 
 
 		 474 aa  449  1e-125  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  48.44 
 
 		 541 aa  422  1e-117  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  47.17 
 
 		 485 aa  424  1e-117  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  47.16 
 
 		 482 aa  417  9.999999999999999e-116  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  47.14 
 
 		 467 aa  389  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  44.81 
 
 		 550 aa  379  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  44.49 
 
 		 506 aa  380  1e-104  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  44.22 
 
 		 542 aa  375  1e-103  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  45.26 
 
 		 483 aa  378  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  44.1 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  44 
 
 		 488 aa  375  1e-102  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  43.61 
 
 		 524 aa  373  1e-102  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  43.91 
 
 		 535 aa  366  1e-100  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  43.54 
 
 		 535 aa  367  1e-100  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  43.96 
 
 		 567 aa  365  1e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  43.7 
 
 		 535 aa  363  3e-99  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 555 aa  361  1e-98  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  42.42 
 
 		 564 aa  361  2e-98  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  44.15 
 
 		 557 aa  353  5e-96  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  39.96 
 
 		 539 aa  351  1e-95  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  43.26 
 
 		 535 aa  350  4e-95  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  39.51 
 
 		 551 aa  349  7e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  42.36 
 
 		 538 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  36.06 
 
 		 576 aa  267  2.9999999999999995e-70  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  33.12 
 
 		 777 aa  203  6e-51  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  32.71 
 
 		 777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  32.08 
 
 		 780 aa  200  3.9999999999999996e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  31.33 
 
 		 793 aa  182  9.000000000000001e-45  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  31.52 
 
 		 630 aa  181  2e-44  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  30.58 
 
 		 715 aa  176  9e-43  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  29.71 
 
 		 605 aa  167  2.9999999999999998e-40  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.27 
 
 		 565 aa  159  1e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.08 
 
 		 587 aa  157  5.0000000000000005e-37  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  31.13 
 
 		 604 aa  156  1e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.21 
 
 		 469 aa  153  5e-36  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  28.75 
 
 		 456 aa  144  3e-33  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  28.34 
 
 		 454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  29.49 
 
 		 458 aa  133  6.999999999999999e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  29.65 
 
 		 457 aa  131  3e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  28.74 
 
 		 459 aa  129  1.0000000000000001e-28  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  29.86 
 
 		 463 aa  127  4.0000000000000003e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  28.89 
 
 		 459 aa  126  8.000000000000001e-28  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  30.36 
 
 		 461 aa  124  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  27.95 
 
 		 459 aa  122  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1385  hypothetical protein  22.94 
 
 		 490 aa  45.1  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  27.41 
 
 		 658 aa  44.3  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>