104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_2713 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  100 
 
 		 658 aa  1377    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0845  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  38.39 
 
 		 757 aa  496  1e-139  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.763615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2603  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like protein  30.31 
 
 		 729 aa  296  6e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.18944  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0109  hypothetical protein  30.47 
 
 		 571 aa  254  3e-66  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0116  hypothetical protein  30.66 
 
 		 566 aa  254  4.0000000000000004e-66  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.7686  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0127  hypothetical protein  30.47 
 
 		 566 aa  251  3e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0113  hypothetical protein  29.62 
 
 		 577 aa  246  9.999999999999999e-64  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.020056  normal  0.620455 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0274  cytochrome c family protein  29.19 
 
 		 619 aa  231  3e-59  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00552346  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0125  hypothetical protein  29.07 
 
 		 618 aa  228  2e-58  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0077  hypothetical protein  28.72 
 
 		 616 aa  226  1e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  1.09082e-34 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0095  hypothetical protein  29.64 
 
 		 616 aa  220  5e-56  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000209926  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2063  hypothetical protein  27.88 
 
 		 615 aa  220  7.999999999999999e-56  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.97808  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0100  cytochrome c family protein  28.92 
 
 		 618 aa  216  9.999999999999999e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000214934  normal  0.444755 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0551  cytochrome c family protein  24.46 
 
 		 688 aa  213  1e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0762772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1404  cytochrome c family protein  26.71 
 
 		 655 aa  212  2e-53  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.352447  normal  0.0404574 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4073  cytochrome c family protein  26.61 
 
 		 662 aa  209  1e-52  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0014  hypothetical protein  27.78 
 
 		 670 aa  192  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0064  cytochrome c family protein  26.57 
 
 		 689 aa  178  2e-43  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0807  cytochrome c family protein  27.34 
 
 		 688 aa  176  9e-43  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3925  hypothetical protein  34.04 
 
 		 236 aa  153  8.999999999999999e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1805  cytochrome C family protein  29.63 
 
 		 346 aa  152  2e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.126894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1876  cytochrome C family protein  30.03 
 
 		 346 aa  150  6e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2002  cytochrome c family protein  29.77 
 
 		 346 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1961  cytochrome C family protein  29.77 
 
 		 346 aa  148  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.613696  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2001  deca-heme C-type cytochrome-like  33.47 
 
 		 241 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1877  deca-heme C-type cytochrome-like protein  33.47 
 
 		 241 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.14633  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1962  deca-heme C-type cytochrome-like protein  33.47 
 
 		 241 aa  139  2e-31  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.282752  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1806  deca-heme C-type cytochrome-like protein  34.65 
 
 		 247 aa  138  3.0000000000000003e-31  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.655576  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3926  hypothetical protein  27.46 
 
 		 211 aa  89.4  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2739  hypothetical protein  27.72 
 
 		 471 aa  89  3e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000852444  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2381  hypothetical protein  32.39 
 
 		 270 aa  65.9  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.145583  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3175  cytochrome c family protein  31.69 
 
 		 266 aa  63.9  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2887  cytochrome c family protein  24.41 
 
 		 884 aa  63.9  0.000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0141387  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2640  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.88 
 
 		 204 aa  63.5  0.00000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.174669 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1086  cytochrome c family protein  31.97 
 
 		 266 aa  62  0.00000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1924  cytochrome c family protein  30.99 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00050556  normal  0.656343 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1573  formate dehydrogenase, gamma subunit  27.27 
 
 		 204 aa  62  0.00000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1648  cytochrome c family protein  29.45 
 
 		 270 aa  61.6  0.00000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1682  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.05 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.798131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1745  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.05 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.504585  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1684  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.673078 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1597  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.05 
 
 		 218 aa  59.3  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1775  formate dehydrogenase-N subunit gamma  20.94 
 
 		 218 aa  59.7  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2928  cytochrome c family protein  30 
 
 		 350 aa  55.8  0.000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000703284  decreased coverage  2.01033e-17 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1577  cytochrome c family protein  28.24 
 
 		 372 aa  54.3  0.000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0598  PKD  24.2 
 
 		 806 aa  53.5  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00146483  normal  0.752324 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0685  formate dehydrogenase gamma subunit  26.74 
 
 		 398 aa  52.8  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.368293  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0676  multihaem cytochrome  25.48 
 
 		 359 aa  51.6  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0594  cytochrome c family protein  34.02 
 
 		 349 aa  51.6  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.127637  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1752  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.09 
 
 		 212 aa  51.6  0.00005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.125669  hitchhiker  0.000744815 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03830  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.27 
 
 		 215 aa  50.8  0.00007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.129559  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0300  hypothetical protein  26.61 
 
 		 461 aa  50.8  0.00008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.124376  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2550  hydroxylamine oxidase  25.44 
 
 		 511 aa  50.8  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3130  cytochrome C family protein  29.02 
 
 		 317 aa  50.1  0.0001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.849943  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0689  multiheme cytochrome  25.31 
 
 		 359 aa  50.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000324131 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0431  flavodoxin domain-containing protein  23.79 
 
 		 883 aa  49.3  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0825  cytochrome c family protein  25.77 
 
 		 305 aa  49.7  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.0140674 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3828  multiheme cytochrome  27.43 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.326628 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1837  cytochrome C family protein  23.78 
 
 		 429 aa  49.7  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  27.55 
 
 		 464 aa  49.7  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1333  formate dehydrogenase-N subunit gamma  22.12 
 
 		 213 aa  49.7  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0653  high-molecular-weight cytochrome c  23.53 
 
 		 555 aa  48.9  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3686  cytochrome C family protein  25.42 
 
 		 314 aa  48.9  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2149  cytochrome c family protein  25.88 
 
 		 304 aa  48.9  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0950345  normal  0.491991 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2660  formate dehydrogenase-N subunit gamma  21.15 
 
 		 213 aa  48.9  0.0003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485157  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0797  formate dehydrogenase gamma subunit  25.55 
 
 		 229 aa  48.5  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.205396  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1208  formate dehydrogenase, gamma subunit, putative  24.49 
 
 		 211 aa  47.8  0.0006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.57 
 
 		 696 aa  47.8  0.0007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1634  hypothetical protein  27.08 
 
 		 463 aa  47.8  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000364247  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01434  formate dehydrogenase-N, cytochrome B556 (gamma) subunit, nitrate-inducible  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2171  formate dehydrogenase, gamma subunit  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.323091  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0913  hypothetical protein  23.94 
 
 		 490 aa  46.6  0.001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.689727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0800  hydroxylamine oxidase  24.16 
 
 		 461 aa  46.6  0.001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000000654333  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2181  formate dehydrogenase-N subunit gamma  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1698  formate dehydrogenase-N subunit gamma  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2349  hypothetical protein  30.97 
 
 		 344 aa  47  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2088  formate dehydrogenase-N subunit gamma  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01446  hypothetical protein  19.75 
 
 		 217 aa  46.6  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1427  decaheme cytochrome c  24.48 
 
 		 318 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0600  PKD  23.27 
 
 		 712 aa  46.2  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000134554  normal  0.252595 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1593  cytochrome C family protein  26.67 
 
 		 321 aa  46.2  0.002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000481816  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  26.29 
 
 		 468 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  25 
 
 		 467 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0231  cytochrome C family protein  25.93 
 
 		 316 aa  45.8  0.002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2583  cytochrome C family protein  27.69 
 
 		 259 aa  46.2  0.002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3263  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.35 
 
 		 215 aa  46.2  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.688526  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4059  formate dehydrogenase, gamma subunit  25.39 
 
 		 408 aa  45.8  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3675  cytochrome C family protein  24.48 
 
 		 315 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2761  cytochrome C family protein  26.83 
 
 		 319 aa  45.4  0.003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.309572  hitchhiker  0.000367908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3025  hypothetical protein  26.07 
 
 		 489 aa  45.1  0.004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2230  cytochrome C family protein  24.9 
 
 		 309 aa  45.4  0.004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0468166  decreased coverage  0.000802637 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3488  formate dehydrogenase, gamma subunit  22.04 
 
 		 208 aa  45.4  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.136501  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1248  hydroxylamine oxidase  25.97 
 
 		 496 aa  45.1  0.004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0152054  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0268  cytochrome C family protein  25.31 
 
 		 314 aa  44.7  0.005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1530  cytochrome c family protein  28.74 
 
 		 321 aa  45.1  0.005  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.892773  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1455  putative formate dehydrogenase  21.74 
 
 		 339 aa  44.7  0.005  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1823  formate dehydrogenase gamma subunit  25.93 
 
 		 219 aa  44.7  0.006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0227  cytochrome c family protein  25.93 
 
 		 316 aa  44.7  0.006  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  27.61 
 
 		 471 aa  44.3  0.007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2758  formate dehydrogenase subunit gamma  25.9 
 
 		 397 aa  43.9  0.009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.073023  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>