58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_1963 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  72.51 
 
 		 535 aa  791    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  74.3 
 
 		 535 aa  873    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  72.2 
 
 		 524 aa  817    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  74.76 
 
 		 535 aa  850    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  100 
 
 		 535 aa  1119    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  72.07 
 
 		 535 aa  810    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  50.1 
 
 		 506 aa  511  1e-144  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 541 aa  498  1e-140  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  48.41 
 
 		 551 aa  501  1e-140  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  50.1 
 
 		 557 aa  498  1e-139  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  50.7 
 
 		 550 aa  498  1e-139  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  50.89 
 
 		 567 aa  493  9.999999999999999e-139  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  46.75 
 
 		 555 aa  492  9.999999999999999e-139  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  49.4 
 
 		 542 aa  486  1e-136  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  46.04 
 
 		 539 aa  478  1e-133  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  48.27 
 
 		 564 aa  476  1e-133  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  50.2 
 
 		 538 aa  462  1e-129  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  46.52 
 
 		 474 aa  397  1e-109  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  44.92 
 
 		 464 aa  390  1e-107  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  44.04 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  44.24 
 
 		 462 aa  389  1e-107  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  46.77 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  44.15 
 
 		 462 aa  387  1e-106  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  45 
 
 		 474 aa  388  1e-106  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  46.55 
 
 		 462 aa  386  1e-106  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  46.22 
 
 		 461 aa  384  1e-105  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  46.55 
 
 		 462 aa  385  1e-105  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  46.7 
 
 		 464 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  43.82 
 
 		 468 aa  379  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  43.67 
 
 		 471 aa  363  4e-99  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  45.5 
 
 		 467 aa  359  7e-98  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  40.43 
 
 		 482 aa  323  4e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  40.64 
 
 		 467 aa  301  2e-80  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  36.67 
 
 		 485 aa  291  2e-77  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  37.77 
 
 		 483 aa  277  4e-73  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  36.53 
 
 		 488 aa  275  1.0000000000000001e-72  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  30.97 
 
 		 576 aa  214  4.9999999999999996e-54  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  29.74 
 
 		 777 aa  181  2e-44  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  29.74 
 
 		 777 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  28.89 
 
 		 780 aa  178  2e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  26.71 
 
 		 793 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  27.11 
 
 		 630 aa  154  5e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  26.37 
 
 		 715 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  26.94 
 
 		 469 aa  143  9.999999999999999e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  28.3 
 
 		 587 aa  140  4.999999999999999e-32  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  25.42 
 
 		 565 aa  135  1.9999999999999998e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  25.75 
 
 		 605 aa  132  1.0000000000000001e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  25.63 
 
 		 604 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.27 
 
 		 456 aa  112  2.0000000000000002e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.17 
 
 		 458 aa  109  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  27.96 
 
 		 461 aa  108  3e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  26.94 
 
 		 463 aa  107  6e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  25.35 
 
 		 457 aa  103  7e-21  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  24.84 
 
 		 459 aa  97.8  4e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  24.84 
 
 		 459 aa  97.1  7e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  24.9 
 
 		 459 aa  95.1  3e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  24.81 
 
 		 454 aa  94.4  5e-18  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0472  cytochrome c family protein  25.1 
 
 		 664 aa  47  0.0008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.482092  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>