59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ssed_4060 on replicon NC_009831
Organism: Shewanella sediminis HAW-EB3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  100 
 
 		 467 aa  979    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  78.91 
 
 		 462 aa  785    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  73.88 
 
 		 471 aa  744    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  79.77 
 
 		 464 aa  764    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  78.91 
 
 		 462 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  78.7 
 
 		 462 aa  783    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  80.34 
 
 		 468 aa  808    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  77.09 
 
 		 462 aa  778    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  77.3 
 
 		 462 aa  780    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  77.09 
 
 		 462 aa  778    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  78.59 
 
 		 461 aa  789    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  51.16 
 
 		 474 aa  471  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  52.79 
 
 		 464 aa  474  1e-132  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  48.33 
 
 		 474 aa  456  1e-127  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  48.18 
 
 		 541 aa  415  1e-114  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  45.15 
 
 		 485 aa  406  1.0000000000000001e-112  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  43.76 
 
 		 482 aa  403  1e-111  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  45.48 
 
 		 542 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  44.92 
 
 		 524 aa  385  1e-105  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  42.89 
 
 		 535 aa  377  1e-103  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  46.36 
 
 		 467 aa  377  1e-103  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  42.51 
 
 		 535 aa  375  1e-102  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  43.79 
 
 		 535 aa  372  1e-102  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  43.2 
 
 		 535 aa  371  1e-101  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  41.58 
 
 		 555 aa  371  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  44.82 
 
 		 506 aa  368  1e-100  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  43.47 
 
 		 564 aa  366  1e-100  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  42.83 
 
 		 567 aa  367  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  46.64 
 
 		 557 aa  366  1e-100  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  44.57 
 
 		 550 aa  367  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  43.75 
 
 		 483 aa  364  2e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  41.35 
 
 		 488 aa  362  9e-99  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  45.05 
 
 		 535 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  41.01 
 
 		 551 aa  341  2e-92  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  38.8 
 
 		 539 aa  332  1e-89  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  41.94 
 
 		 538 aa  318  1e-85  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  37.4 
 
 		 576 aa  271  2e-71  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  32.36 
 
 		 777 aa  201  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  32.13 
 
 		 777 aa  199  9e-50  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  32.13 
 
 		 780 aa  199  1.0000000000000001e-49  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  30.22 
 
 		 793 aa  174  3.9999999999999995e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  30.22 
 
 		 630 aa  173  5.999999999999999e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  31.01 
 
 		 605 aa  172  1e-41  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  29.75 
 
 		 587 aa  170  5e-41  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  29.32 
 
 		 715 aa  164  3e-39  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  30.02 
 
 		 469 aa  157  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  27.66 
 
 		 565 aa  157  3e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  28.81 
 
 		 604 aa  146  7.0000000000000006e-34  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  27.86 
 
 		 456 aa  138  2e-31  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  27.75 
 
 		 458 aa  134  3e-30  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  29.29 
 
 		 459 aa  131  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  29.09 
 
 		 459 aa  129  9.000000000000001e-29  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  26.72 
 
 		 454 aa  127  3e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  29.44 
 
 		 463 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  28.25 
 
 		 457 aa  123  6e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  28.57 
 
 		 459 aa  119  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  28.79 
 
 		 461 aa  114  4.0000000000000004e-24  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1385  hypothetical protein  23.59 
 
 		 490 aa  48.5  0.0002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.104459  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2713  cytochrome b subunit of formate dehydrogenase-like  25 
 
 		 658 aa  45.8  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151641  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>