61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene GM21_0773 on replicon NC_012918
Organism: Geobacter sp. M21



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002939  GSU2201  cytochrome c family protein  73.06 
 
 		 456 aa  713    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.826403  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1031  cytochrome c family protein  75.38 
 
 		 459 aa  724    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0773  hypothetical protein  100 
 
 		 463 aa  964    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3130  hypothetical protein  79.91 
 
 		 457 aa  783    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000612251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0758  hypothetical protein  93.74 
 
 		 461 aa  895    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0125209  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1034  cytochrome c family protein  75.16 
 
 		 459 aa  723    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0972  cytochrome c family protein  77.7 
 
 		 459 aa  715    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.842285  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3088  cytochrome c family protein  69.13 
 
 		 454 aa  683    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2593  cytochrome c family protein  64.66 
 
 		 458 aa  619  1e-176  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.121764  normal  0.0613403 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1588  cytochrome c, putative  30.63 
 
 		 474 aa  164  5.0000000000000005e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.290166  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0672  hypothetical protein  29.89 
 
 		 469 aa  160  4e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.269151  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1719  cytochrome c, putative  31.04 
 
 		 464 aa  156  8e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.668861  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2299  cytochrome c family protein  29.01 
 
 		 482 aa  146  9e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.00176579  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0860  cytochrome c, putative  30.66 
 
 		 474 aa  142  9.999999999999999e-33  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.199105  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1177  cytochrome c family protein  29.76 
 
 		 483 aa  134  3e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.156142  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1764  cytochrome c family protein  28.31 
 
 		 488 aa  133  6e-30  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.104352  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0514  cytochrome c, putative  28.39 
 
 		 468 aa  131  3e-29  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.829672  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0477  cytochrome c, putative  29.07 
 
 		 462 aa  130  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0482  cytochrome c, putative  29.07 
 
 		 462 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0458  cytochrome c, putative  28.83 
 
 		 462 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3556  cytochrome c, putative  29.65 
 
 		 464 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.205085  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3180  cytochrome c, putative  29.86 
 
 		 471 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4144  cytochrome c, putative  28.8 
 
 		 461 aa  127  4.0000000000000003e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3690  cytochrome c, putative  29.18 
 
 		 462 aa  127  5e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3513  cytochrome c, putative  28.43 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0774  cytochrome c family protein  28.46 
 
 		 485 aa  124  3e-27  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0439  cytochrome c, putative  28.37 
 
 		 462 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1467  hypothetical protein  25.35 
 
 		 715 aa  124  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3048  hypothetical protein  25.38 
 
 		 630 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.241628  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1468  hypothetical protein  25.59 
 
 		 793 aa  121  3e-26  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0877  cytochrome c family protein  28.85 
 
 		 551 aa  120  7.999999999999999e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0155684  normal  0.0847059 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2160  cytochrome c family protein  27.43 
 
 		 535 aa  115  2.0000000000000002e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2147  cytochrome c, putative  27.76 
 
 		 467 aa  115  2.0000000000000002e-24  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0772  hypothetical protein  24.04 
 
 		 565 aa  114  3e-24  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.613527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2426  cytochrome c family protein  26.8 
 
 		 535 aa  111  2.0000000000000002e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1197  cytochrome c family protein  27.06 
 
 		 524 aa  110  4.0000000000000004e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0376  cytochrome c family protein  25.98 
 
 		 539 aa  110  7.000000000000001e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4060  cytochrome c, putative  29.12 
 
 		 467 aa  109  9.000000000000001e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1181  hypothetical protein  26.1 
 
 		 576 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.173065 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3635  cytochrome c family protein  29.38 
 
 		 538 aa  103  8e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.627194  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3005  cytochrome c family protein  27.43 
 
 		 567 aa  102  2e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.0000166322  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2104  cytochrome c family protein  26.19 
 
 		 535 aa  102  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3749  hypothetical protein  26.05 
 
 		 605 aa  101  3e-20  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0167  cytochrome c family protein  26.35 
 
 		 557 aa  100  6e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.333474  normal  0.1597 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0090  cytochrome c family protein  26.89 
 
 		 550 aa  100  6e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.424796  unclonable  0.0000109352 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1392  cytochrome c family protein  26.75 
 
 		 541 aa  99.4  1e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.791817  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2064  cytochrome c family protein  26.94 
 
 		 535 aa  99  2e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1724  hypothetical protein  26.69 
 
 		 604 aa  97.1  5e-19  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0242  cytochrome c family protein  26.18 
 
 		 542 aa  96.7  8e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.587996  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1963  cytochrome c family protein  26.72 
 
 		 535 aa  94.7  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0245896  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3142  cytochrome c family protein  24.68 
 
 		 506 aa  93.6  6e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.144797  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0149  cytochrome c family protein  24.43 
 
 		 555 aa  92.4  1e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1694  cytochrome c family protein  25.68 
 
 		 564 aa  92.8  1e-17  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2184  hypothetical protein  24.93 
 
 		 587 aa  83.2  0.000000000000009  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.287741  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1427  formate dehydrogenase, gamma subunit  26.67 
 
 		 696 aa  56.2  0.000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000366898  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3190  hypothetical protein  24.62 
 
 		 777 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.250206  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3284  hypothetical protein  23.69 
 
 		 777 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.374959  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3090  hypothetical protein  33.1 
 
 		 780 aa  51.2  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0732666  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2825  cytochrome c family protein  24.59 
 
 		 625 aa  48.5  0.0002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0166029  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2006  cytochrome c family protein  26.83 
 
 		 623 aa  46.6  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.695915  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2216  cytochrome c family protein  26.22 
 
 		 623 aa  44.7  0.004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000696852 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>